Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NOTOA8MTQ0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NOTOA8MTQ0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NOTOA8MTQ0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NOTOA8MTQ0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NOTOA8MTQ0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NOTOA8MTQ0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NOTOA8MTQ0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NOTOA8MTQ0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NOTOA8MTQ0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NOTOA8MTQ0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NOTOA8MTQ0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NOTOA8MTQ0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NOTOA8MTQ0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NOTOA8MTQ0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NOTOA8MTQ0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NOTOA8MTQ0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NOTOA8MTQ0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NOTOA8MTQ0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NOTOA8MTQ0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NOTOA8MTQ0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NOTOA8MTQ0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NOTOA8MTQ0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NOTOA8MTQ0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NOTOA8MTQ0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NOTOA8MTQ0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NOTOA8MTQ0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NOTOA8MTQ0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NOTOA8MTQ0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NOTOA8MTQ0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NOTOA8MTQ0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NOTOA8MTQ0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NOTOA8MTQ0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NOTOA8MTQ0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NOTOA8MTQ0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NOTOA8MTQ0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NOTOA8MTQ0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NOTOA8MTQ0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NOTOA8MTQ0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NOTOA8MTQ0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NOTOA8MTQ0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NOTOA8MTQ0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NOTOA8MTQ0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NOTOA8MTQ0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NOTOA8MTQ0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NOTOA8MTQ0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NOTOA8MTQ0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NOTOA8MTQ0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NOTOA8MTQ0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NOTOA8MTQ0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NOTOA8MTQ0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NOTOA8MTQ0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NOTOA8MTQ0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NOTOA8MTQ0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NOTOA8MTQ0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NOTOA8MTQ0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NOTOA8MTQ0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NOTOA8MTQ0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NOTOA8MTQ0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NOTOA8MTQ0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NOTOA8MTQ0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NOTOA8MTQ0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NOTOA8MTQ0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NOTOA8MTQ0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NOTOA8MTQ0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NOTOA8MTQ0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NOTOA8MTQ0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NOTOA8MTQ0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NOTOA8MTQ0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NOTOA8MTQ0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NOTOA8MTQ0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NOTOA8MTQ0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NOTOA8MTQ0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NOTOA8MTQ0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NOTOA8MTQ0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NOTOA8MTQ0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NOTOA8MTQ0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NOTOA8MTQ0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NOTOA8MTQ0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NOTOA8MTQ0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NOTOA8MTQ0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NOTOA8MTQ0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NOTOA8MTQ0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NOTOA8MTQ0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NOTOA8MTQ0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NOTOA8MTQ0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NOTOA8MTQ0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NOTOA8MTQ0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NOTOA8MTQ0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NOTOA8MTQ0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NOTOA8MTQ0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NOTOA8MTQ0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NOTOA8MTQ0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOTOA8MTQ0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOTOA8MTQ0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOTOA8MTQ0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOTOA8MTQ0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NOTOA8MTQ0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOTOA8MTQ0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOTOA8MTQ0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms