Protein–RNA interactions for Protein: A8K0Z3

WASHC1, WASH complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC1A8K0Z3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
WASHC1A8K0Z3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
WASHC1A8K0Z3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
WASHC1A8K0Z3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
WASHC1A8K0Z3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
WASHC1A8K0Z3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
WASHC1A8K0Z3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
WASHC1A8K0Z3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
WASHC1A8K0Z3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
WASHC1A8K0Z3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
WASHC1A8K0Z3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
WASHC1A8K0Z3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
WASHC1A8K0Z3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
WASHC1A8K0Z3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
WASHC1A8K0Z3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
WASHC1A8K0Z3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
WASHC1A8K0Z3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
WASHC1A8K0Z3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
WASHC1A8K0Z3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
WASHC1A8K0Z3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
WASHC1A8K0Z3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
WASHC1A8K0Z3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
WASHC1A8K0Z3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
WASHC1A8K0Z3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
WASHC1A8K0Z3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
WASHC1A8K0Z3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
WASHC1A8K0Z3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
WASHC1A8K0Z3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
WASHC1A8K0Z3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
WASHC1A8K0Z3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
WASHC1A8K0Z3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
WASHC1A8K0Z3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
WASHC1A8K0Z3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
WASHC1A8K0Z3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
WASHC1A8K0Z3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
WASHC1A8K0Z3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
WASHC1A8K0Z3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
WASHC1A8K0Z3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
WASHC1A8K0Z3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
WASHC1A8K0Z3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
WASHC1A8K0Z3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
WASHC1A8K0Z3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
WASHC1A8K0Z3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
WASHC1A8K0Z3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
WASHC1A8K0Z3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
WASHC1A8K0Z3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
WASHC1A8K0Z3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
WASHC1A8K0Z3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
WASHC1A8K0Z3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
WASHC1A8K0Z3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
WASHC1A8K0Z3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
WASHC1A8K0Z3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
WASHC1A8K0Z3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
WASHC1A8K0Z3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
WASHC1A8K0Z3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
WASHC1A8K0Z3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
WASHC1A8K0Z3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
WASHC1A8K0Z3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
WASHC1A8K0Z3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
WASHC1A8K0Z3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
WASHC1A8K0Z3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
WASHC1A8K0Z3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
WASHC1A8K0Z3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
WASHC1A8K0Z3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
WASHC1A8K0Z3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
WASHC1A8K0Z3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
WASHC1A8K0Z3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
WASHC1A8K0Z3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
WASHC1A8K0Z3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
WASHC1A8K0Z3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
WASHC1A8K0Z3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
WASHC1A8K0Z3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
WASHC1A8K0Z3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WASHC1A8K0Z3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WASHC1A8K0Z3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
WASHC1A8K0Z3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
WASHC1A8K0Z3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WASHC1A8K0Z3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
WASHC1A8K0Z3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
WASHC1A8K0Z3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WASHC1A8K0Z3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
WASHC1A8K0Z3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
WASHC1A8K0Z3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
WASHC1A8K0Z3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WASHC1A8K0Z3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
WASHC1A8K0Z3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WASHC1A8K0Z3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WASHC1A8K0Z3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
WASHC1A8K0Z3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WASHC1A8K0Z3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
WASHC1A8K0Z3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
WASHC1A8K0Z3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
WASHC1A8K0Z3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
WASHC1A8K0Z3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
WASHC1A8K0Z3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
WASHC1A8K0Z3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
WASHC1A8K0Z3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
WASHC1A8K0Z3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
WASHC1A8K0Z3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
WASHC1A8K0Z3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms