Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-M5A7VMS3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-M5A7VMS3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-M5A7VMS3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-M5A7VMS3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
H2-M5A7VMS3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-M5A7VMS3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-M5A7VMS3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-M5A7VMS3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-M5A7VMS3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-M5A7VMS3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-M5A7VMS3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-M5A7VMS3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-M5A7VMS3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-M5A7VMS3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-M5A7VMS3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-M5A7VMS3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-M5A7VMS3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-M5A7VMS3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-M5A7VMS3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-M5A7VMS3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-M5A7VMS3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-M5A7VMS3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-M5A7VMS3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-M5A7VMS3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-M5A7VMS3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-M5A7VMS3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-M5A7VMS3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-M5A7VMS3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-M5A7VMS3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-M5A7VMS3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-M5A7VMS3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-M5A7VMS3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-M5A7VMS3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-M5A7VMS3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-M5A7VMS3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-M5A7VMS3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-M5A7VMS3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-M5A7VMS3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-M5A7VMS3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-M5A7VMS3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-M5A7VMS3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-M5A7VMS3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-M5A7VMS3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-M5A7VMS3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-M5A7VMS3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
H2-M5A7VMS3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
H2-M5A7VMS3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2-M5A7VMS3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2-M5A7VMS3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2-M5A7VMS3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2-M5A7VMS3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-M5A7VMS3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-M5A7VMS3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-M5A7VMS3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-M5A7VMS3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-M5A7VMS3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-M5A7VMS3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-M5A7VMS3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-M5A7VMS3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-M5A7VMS3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-M5A7VMS3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-M5A7VMS3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-M5A7VMS3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-M5A7VMS3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-M5A7VMS3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2-M5A7VMS3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2-M5A7VMS3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-M5A7VMS3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-M5A7VMS3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-M5A7VMS3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-M5A7VMS3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-M5A7VMS3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-M5A7VMS3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-M5A7VMS3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-M5A7VMS3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-M5A7VMS3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-M5A7VMS3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-M5A7VMS3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-M5A7VMS3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-M5A7VMS3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-M5A7VMS3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-M5A7VMS3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-M5A7VMS3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-M5A7VMS3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
H2-M5A7VMS3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
H2-M5A7VMS3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-M5A7VMS3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-M5A7VMS3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-M5A7VMS3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-M5A7VMS3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-M5A7VMS3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
H2-M5A7VMS3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-M5A7VMS3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
H2-M5A7VMS3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-M5A7VMS3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-M5A7VMS3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-M5A7VMS3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-M5A7VMS3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-M5A7VMS3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms