Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC169A6NNP5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC169A6NNP5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC169A6NNP5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC169A6NNP5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC169A6NNP5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC169A6NNP5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC169A6NNP5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC169A6NNP5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC169A6NNP5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC169A6NNP5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC169A6NNP5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC169A6NNP5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC169A6NNP5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC169A6NNP5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC169A6NNP5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC169A6NNP5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC169A6NNP5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC169A6NNP5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC169A6NNP5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC169A6NNP5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC169A6NNP5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC169A6NNP5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC169A6NNP5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC169A6NNP5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC169A6NNP5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC169A6NNP5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC169A6NNP5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC169A6NNP5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC169A6NNP5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC169A6NNP5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC169A6NNP5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC169A6NNP5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC169A6NNP5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC169A6NNP5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC169A6NNP5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC169A6NNP5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC169A6NNP5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC169A6NNP5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC169A6NNP5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC169A6NNP5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC169A6NNP5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC169A6NNP5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC169A6NNP5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC169A6NNP5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CCDC169A6NNP5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC169A6NNP5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC169A6NNP5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC169A6NNP5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC169A6NNP5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC169A6NNP5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC169A6NNP5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC169A6NNP5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC169A6NNP5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC169A6NNP5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC169A6NNP5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC169A6NNP5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC169A6NNP5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC169A6NNP5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC169A6NNP5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC169A6NNP5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC169A6NNP5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CCDC169A6NNP5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC169A6NNP5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CCDC169A6NNP5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC169A6NNP5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC169A6NNP5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC169A6NNP5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC169A6NNP5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC169A6NNP5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC169A6NNP5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC169A6NNP5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC169A6NNP5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC169A6NNP5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC169A6NNP5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC169A6NNP5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC169A6NNP5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC169A6NNP5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC169A6NNP5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC169A6NNP5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC169A6NNP5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC169A6NNP5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC169A6NNP5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC169A6NNP5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC169A6NNP5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC169A6NNP5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC169A6NNP5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC169A6NNP5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC169A6NNP5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC169A6NNP5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC169A6NNP5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC169A6NNP5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC169A6NNP5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC169A6NNP5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC169A6NNP5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC169A6NNP5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC169A6NNP5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC169A6NNP5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC169A6NNP5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC169A6NNP5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms