Protein–RNA interactions for Protein: A6NIU2

LINC01549, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01549, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01549A6NIU2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC01549A6NIU2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC01549A6NIU2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC01549A6NIU2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01549A6NIU2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01549A6NIU2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01549A6NIU2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01549A6NIU2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01549A6NIU2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01549A6NIU2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC01549A6NIU2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC01549A6NIU2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC01549A6NIU2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC01549A6NIU2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC01549A6NIU2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC01549A6NIU2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC01549A6NIU2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC01549A6NIU2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC01549A6NIU2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC01549A6NIU2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC01549A6NIU2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC01549A6NIU2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC01549A6NIU2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC01549A6NIU2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC01549A6NIU2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC01549A6NIU2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC01549A6NIU2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC01549A6NIU2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC01549A6NIU2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC01549A6NIU2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC01549A6NIU2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC01549A6NIU2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC01549A6NIU2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC01549A6NIU2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC01549A6NIU2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC01549A6NIU2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC01549A6NIU2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC01549A6NIU2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC01549A6NIU2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC01549A6NIU2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC01549A6NIU2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC01549A6NIU2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC01549A6NIU2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC01549A6NIU2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC01549A6NIU2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC01549A6NIU2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC01549A6NIU2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC01549A6NIU2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC01549A6NIU2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC01549A6NIU2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC01549A6NIU2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC01549A6NIU2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC01549A6NIU2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC01549A6NIU2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC01549A6NIU2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC01549A6NIU2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC01549A6NIU2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC01549A6NIU2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC01549A6NIU2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC01549A6NIU2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC01549A6NIU2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC01549A6NIU2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC01549A6NIU2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC01549A6NIU2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC01549A6NIU2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC01549A6NIU2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC01549A6NIU2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC01549A6NIU2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC01549A6NIU2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC01549A6NIU2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC01549A6NIU2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LINC01549A6NIU2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LINC01549A6NIU2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC01549A6NIU2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC01549A6NIU2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC01549A6NIU2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC01549A6NIU2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC01549A6NIU2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC01549A6NIU2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC01549A6NIU2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC01549A6NIU2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC01549A6NIU2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC01549A6NIU2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC01549A6NIU2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC01549A6NIU2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC01549A6NIU2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC01549A6NIU2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC01549A6NIU2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC01549A6NIU2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC01549A6NIU2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC01549A6NIU2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC01549A6NIU2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC01549A6NIU2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC01549A6NIU2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC01549A6NIU2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC01549A6NIU2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC01549A6NIU2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC01549A6NIU2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC01549A6NIU2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC01549A6NIU2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms