Protein–RNA interactions for Protein: A6NFA1

TRABD2B, Metalloprotease TIKI2, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABD2BA6NFA1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TRABD2BA6NFA1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRABD2BA6NFA1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRABD2BA6NFA1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRABD2BA6NFA1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRABD2BA6NFA1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TRABD2BA6NFA1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRABD2BA6NFA1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TRABD2BA6NFA1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRABD2BA6NFA1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRABD2BA6NFA1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRABD2BA6NFA1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRABD2BA6NFA1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRABD2BA6NFA1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRABD2BA6NFA1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRABD2BA6NFA1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRABD2BA6NFA1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRABD2BA6NFA1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRABD2BA6NFA1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRABD2BA6NFA1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRABD2BA6NFA1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRABD2BA6NFA1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRABD2BA6NFA1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRABD2BA6NFA1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRABD2BA6NFA1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRABD2BA6NFA1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRABD2BA6NFA1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRABD2BA6NFA1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRABD2BA6NFA1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRABD2BA6NFA1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRABD2BA6NFA1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRABD2BA6NFA1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TRABD2BA6NFA1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRABD2BA6NFA1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRABD2BA6NFA1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRABD2BA6NFA1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRABD2BA6NFA1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRABD2BA6NFA1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRABD2BA6NFA1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRABD2BA6NFA1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRABD2BA6NFA1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRABD2BA6NFA1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRABD2BA6NFA1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRABD2BA6NFA1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRABD2BA6NFA1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRABD2BA6NFA1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRABD2BA6NFA1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TRABD2BA6NFA1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TRABD2BA6NFA1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRABD2BA6NFA1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRABD2BA6NFA1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRABD2BA6NFA1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRABD2BA6NFA1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRABD2BA6NFA1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRABD2BA6NFA1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRABD2BA6NFA1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRABD2BA6NFA1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRABD2BA6NFA1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRABD2BA6NFA1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRABD2BA6NFA1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRABD2BA6NFA1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRABD2BA6NFA1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRABD2BA6NFA1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRABD2BA6NFA1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRABD2BA6NFA1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRABD2BA6NFA1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRABD2BA6NFA1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRABD2BA6NFA1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TRABD2BA6NFA1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TRABD2BA6NFA1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRABD2BA6NFA1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRABD2BA6NFA1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRABD2BA6NFA1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRABD2BA6NFA1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRABD2BA6NFA1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRABD2BA6NFA1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TRABD2BA6NFA1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRABD2BA6NFA1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRABD2BA6NFA1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRABD2BA6NFA1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRABD2BA6NFA1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRABD2BA6NFA1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TRABD2BA6NFA1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRABD2BA6NFA1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRABD2BA6NFA1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRABD2BA6NFA1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRABD2BA6NFA1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRABD2BA6NFA1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRABD2BA6NFA1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TRABD2BA6NFA1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRABD2BA6NFA1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRABD2BA6NFA1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRABD2BA6NFA1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRABD2BA6NFA1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TRABD2BA6NFA1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TRABD2BA6NFA1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRABD2BA6NFA1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRABD2BA6NFA1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRABD2BA6NFA1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRABD2BA6NFA1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms