Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GOLGA6L9A6NEM1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GOLGA6L9A6NEM1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GOLGA6L9A6NEM1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GOLGA6L9A6NEM1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GOLGA6L9A6NEM1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GOLGA6L9A6NEM1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GOLGA6L9A6NEM1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GOLGA6L9A6NEM1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GOLGA6L9A6NEM1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GOLGA6L9A6NEM1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GOLGA6L9A6NEM1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GOLGA6L9A6NEM1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GOLGA6L9A6NEM1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GOLGA6L9A6NEM1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GOLGA6L9A6NEM1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GOLGA6L9A6NEM1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GOLGA6L9A6NEM1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
GOLGA6L9A6NEM1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
GOLGA6L9A6NEM1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GOLGA6L9A6NEM1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GOLGA6L9A6NEM1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GOLGA6L9A6NEM1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GOLGA6L9A6NEM1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GOLGA6L9A6NEM1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GOLGA6L9A6NEM1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GOLGA6L9A6NEM1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GOLGA6L9A6NEM1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GOLGA6L9A6NEM1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GOLGA6L9A6NEM1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GOLGA6L9A6NEM1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GOLGA6L9A6NEM1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GOLGA6L9A6NEM1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GOLGA6L9A6NEM1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GOLGA6L9A6NEM1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GOLGA6L9A6NEM1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GOLGA6L9A6NEM1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GOLGA6L9A6NEM1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GOLGA6L9A6NEM1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
GOLGA6L9A6NEM1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GOLGA6L9A6NEM1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GOLGA6L9A6NEM1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GOLGA6L9A6NEM1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GOLGA6L9A6NEM1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GOLGA6L9A6NEM1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GOLGA6L9A6NEM1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GOLGA6L9A6NEM1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GOLGA6L9A6NEM1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GOLGA6L9A6NEM1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GOLGA6L9A6NEM1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLGA6L9A6NEM1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLGA6L9A6NEM1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLGA6L9A6NEM1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLGA6L9A6NEM1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLGA6L9A6NEM1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA6L9A6NEM1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA6L9A6NEM1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA6L9A6NEM1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GOLGA6L9A6NEM1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GOLGA6L9A6NEM1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GOLGA6L9A6NEM1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GOLGA6L9A6NEM1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GOLGA6L9A6NEM1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GOLGA6L9A6NEM1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GOLGA6L9A6NEM1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GOLGA6L9A6NEM1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GOLGA6L9A6NEM1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GOLGA6L9A6NEM1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GOLGA6L9A6NEM1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GOLGA6L9A6NEM1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GOLGA6L9A6NEM1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
GOLGA6L9A6NEM1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GOLGA6L9A6NEM1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GOLGA6L9A6NEM1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GOLGA6L9A6NEM1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GOLGA6L9A6NEM1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GOLGA6L9A6NEM1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GOLGA6L9A6NEM1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GOLGA6L9A6NEM1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GOLGA6L9A6NEM1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GOLGA6L9A6NEM1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GOLGA6L9A6NEM1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
GOLGA6L9A6NEM1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GOLGA6L9A6NEM1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GOLGA6L9A6NEM1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GOLGA6L9A6NEM1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GOLGA6L9A6NEM1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GOLGA6L9A6NEM1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GOLGA6L9A6NEM1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GOLGA6L9A6NEM1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GOLGA6L9A6NEM1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GOLGA6L9A6NEM1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GOLGA6L9A6NEM1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GOLGA6L9A6NEM1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GOLGA6L9A6NEM1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GOLGA6L9A6NEM1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
GOLGA6L9A6NEM1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms