Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM247A6NEH6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM247A6NEH6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM247A6NEH6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM247A6NEH6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM247A6NEH6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM247A6NEH6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM247A6NEH6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM247A6NEH6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM247A6NEH6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM247A6NEH6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM247A6NEH6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM247A6NEH6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM247A6NEH6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM247A6NEH6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMEM247A6NEH6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM247A6NEH6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM247A6NEH6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM247A6NEH6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM247A6NEH6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM247A6NEH6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM247A6NEH6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM247A6NEH6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM247A6NEH6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM247A6NEH6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM247A6NEH6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM247A6NEH6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM247A6NEH6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM247A6NEH6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM247A6NEH6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM247A6NEH6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM247A6NEH6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM247A6NEH6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM247A6NEH6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM247A6NEH6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM247A6NEH6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM247A6NEH6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM247A6NEH6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM247A6NEH6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM247A6NEH6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM247A6NEH6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM247A6NEH6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM247A6NEH6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM247A6NEH6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM247A6NEH6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM247A6NEH6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM247A6NEH6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM247A6NEH6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM247A6NEH6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM247A6NEH6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM247A6NEH6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM247A6NEH6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM247A6NEH6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM247A6NEH6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM247A6NEH6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM247A6NEH6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM247A6NEH6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM247A6NEH6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM247A6NEH6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM247A6NEH6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM247A6NEH6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM247A6NEH6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM247A6NEH6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM247A6NEH6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM247A6NEH6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM247A6NEH6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM247A6NEH6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM247A6NEH6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM247A6NEH6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM247A6NEH6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM247A6NEH6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM247A6NEH6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM247A6NEH6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM247A6NEH6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM247A6NEH6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM247A6NEH6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM247A6NEH6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM247A6NEH6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM247A6NEH6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM247A6NEH6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM247A6NEH6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM247A6NEH6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM247A6NEH6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM247A6NEH6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM247A6NEH6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM247A6NEH6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM247A6NEH6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM247A6NEH6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM247A6NEH6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM247A6NEH6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM247A6NEH6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM247A6NEH6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM247A6NEH6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM247A6NEH6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM247A6NEH6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM247A6NEH6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM247A6NEH6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM247A6NEH6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM247A6NEH6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM247A6NEH6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms