Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
A4D1N5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
A4D1N5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
A4D1N5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
A4D1N5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
A4D1N5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
A4D1N5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
A4D1N5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
A4D1N5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
A4D1N5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
A4D1N5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
A4D1N5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
A4D1N5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
A4D1N5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
A4D1N5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
A4D1N5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
A4D1N5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
A4D1N5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
A4D1N5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
A4D1N5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
A4D1N5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
A4D1N5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
A4D1N5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
A4D1N5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
A4D1N5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
A4D1N5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
A4D1N5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
A4D1N5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
A4D1N5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
A4D1N5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
A4D1N5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
A4D1N5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A4D1N5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
A4D1N5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
A4D1N5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A4D1N5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
A4D1N5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
A4D1N5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
A4D1N5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A4D1N5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
A4D1N5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
A4D1N5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
A4D1N5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
A4D1N5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
A4D1N5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
A4D1N5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
A4D1N5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
A4D1N5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
A4D1N5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
A4D1N5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
A4D1N5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
A4D1N5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
A4D1N5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
A4D1N5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
A4D1N5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
A4D1N5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A4D1N5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A4D1N5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
A4D1N5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A4D1N5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A4D1N5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A4D1N5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
A4D1N5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A4D1N5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A4D1N5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A4D1N5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
A4D1N5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
A4D1N5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A4D1N5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A4D1N5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A4D1N5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A4D1N5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A4D1N5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A4D1N5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A4D1N5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
A4D1N5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A4D1N5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A4D1N5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A4D1N5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A4D1N5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A4D1N5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A4D1N5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A4D1N5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A4D1N5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A4D1N5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A4D1N5 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A4D1N5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A4D1N5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A4D1N5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A4D1N5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A4D1N5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A4D1N5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
A4D1N5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A4D1N5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A4D1N5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A4D1N5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A4D1N5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A4D1N5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A4D1N5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A4D1N5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms