Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Odf2A3KGV1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Odf2A3KGV1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Odf2A3KGV1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Odf2A3KGV1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Odf2A3KGV1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Odf2A3KGV1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Odf2A3KGV1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Odf2A3KGV1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Odf2A3KGV1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Odf2A3KGV1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Odf2A3KGV1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Odf2A3KGV1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Odf2A3KGV1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Odf2A3KGV1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Odf2A3KGV1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Odf2A3KGV1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Odf2A3KGV1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Odf2A3KGV1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Odf2A3KGV1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Odf2A3KGV1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Odf2A3KGV1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Odf2A3KGV1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Odf2A3KGV1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Odf2A3KGV1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Odf2A3KGV1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Odf2A3KGV1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Odf2A3KGV1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Odf2A3KGV1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Odf2A3KGV1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Odf2A3KGV1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Odf2A3KGV1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Odf2A3KGV1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Odf2A3KGV1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Odf2A3KGV1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Odf2A3KGV1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Odf2A3KGV1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Odf2A3KGV1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Odf2A3KGV1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Odf2A3KGV1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Odf2A3KGV1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Odf2A3KGV1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Odf2A3KGV1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Odf2A3KGV1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Odf2A3KGV1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Odf2A3KGV1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Odf2A3KGV1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Odf2A3KGV1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Odf2A3KGV1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Odf2A3KGV1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Odf2A3KGV1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Odf2A3KGV1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Odf2A3KGV1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Odf2A3KGV1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Odf2A3KGV1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Odf2A3KGV1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Odf2A3KGV1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Odf2A3KGV1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Odf2A3KGV1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Odf2A3KGV1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Odf2A3KGV1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Odf2A3KGV1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Odf2A3KGV1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Odf2A3KGV1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Odf2A3KGV1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Odf2A3KGV1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Odf2A3KGV1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Odf2A3KGV1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Odf2A3KGV1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Odf2A3KGV1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Odf2A3KGV1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Odf2A3KGV1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Odf2A3KGV1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Odf2A3KGV1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Odf2A3KGV1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Odf2A3KGV1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Odf2A3KGV1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Odf2A3KGV1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Odf2A3KGV1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Odf2A3KGV1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Odf2A3KGV1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Odf2A3KGV1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Odf2A3KGV1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Odf2A3KGV1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Odf2A3KGV1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Odf2A3KGV1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Odf2A3KGV1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Odf2A3KGV1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Odf2A3KGV1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Odf2A3KGV1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Odf2A3KGV1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Odf2A3KGV1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Odf2A3KGV1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Odf2A3KGV1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Odf2A3KGV1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Odf2A3KGV1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Odf2A3KGV1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Odf2A3KGV1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Odf2A3KGV1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Odf2A3KGV1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms