Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Palm3A2TJV2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Palm3A2TJV2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Palm3A2TJV2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Palm3A2TJV2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Palm3A2TJV2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Palm3A2TJV2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Palm3A2TJV2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Palm3A2TJV2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Palm3A2TJV2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Palm3A2TJV2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Palm3A2TJV2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Palm3A2TJV2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Palm3A2TJV2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Palm3A2TJV2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Palm3A2TJV2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Palm3A2TJV2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Palm3A2TJV2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Palm3A2TJV2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Palm3A2TJV2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Palm3A2TJV2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Palm3A2TJV2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Palm3A2TJV2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Palm3A2TJV2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Palm3A2TJV2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Palm3A2TJV2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Palm3A2TJV2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Palm3A2TJV2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Palm3A2TJV2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Palm3A2TJV2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Palm3A2TJV2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Palm3A2TJV2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Palm3A2TJV2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Palm3A2TJV2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Palm3A2TJV2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Palm3A2TJV2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Palm3A2TJV2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Palm3A2TJV2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Palm3A2TJV2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Palm3A2TJV2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Palm3A2TJV2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Palm3A2TJV2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Palm3A2TJV2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Palm3A2TJV2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Palm3A2TJV2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Palm3A2TJV2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Palm3A2TJV2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Palm3A2TJV2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Palm3A2TJV2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Palm3A2TJV2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Palm3A2TJV2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Palm3A2TJV2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Palm3A2TJV2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Palm3A2TJV2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Palm3A2TJV2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Palm3A2TJV2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Palm3A2TJV2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Palm3A2TJV2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Palm3A2TJV2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Palm3A2TJV2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Palm3A2TJV2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Palm3A2TJV2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Palm3A2TJV2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Palm3A2TJV2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Palm3A2TJV2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Palm3A2TJV2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Palm3A2TJV2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Palm3A2TJV2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Palm3A2TJV2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Palm3A2TJV2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Palm3A2TJV2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Palm3A2TJV2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Palm3A2TJV2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Palm3A2TJV2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Palm3A2TJV2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Palm3A2TJV2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Palm3A2TJV2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Palm3A2TJV2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Palm3A2TJV2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Palm3A2TJV2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Palm3A2TJV2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Palm3A2TJV2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Palm3A2TJV2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Palm3A2TJV2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Palm3A2TJV2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Palm3A2TJV2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Palm3A2TJV2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Palm3A2TJV2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Palm3A2TJV2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Palm3A2TJV2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Palm3A2TJV2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Palm3A2TJV2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Palm3A2TJV2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Palm3A2TJV2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Palm3A2TJV2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Palm3A2TJV2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Palm3A2TJV2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Palm3A2TJV2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Palm3A2TJV2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Palm3A2TJV2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms