Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tubb1A2AQ07 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tubb1A2AQ07 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tubb1A2AQ07 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tubb1A2AQ07 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tubb1A2AQ07 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tubb1A2AQ07 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tubb1A2AQ07 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tubb1A2AQ07 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tubb1A2AQ07 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tubb1A2AQ07 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tubb1A2AQ07 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tubb1A2AQ07 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tubb1A2AQ07 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tubb1A2AQ07 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tubb1A2AQ07 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tubb1A2AQ07 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tubb1A2AQ07 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tubb1A2AQ07 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tubb1A2AQ07 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tubb1A2AQ07 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tubb1A2AQ07 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tubb1A2AQ07 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tubb1A2AQ07 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Tubb1A2AQ07 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Tubb1A2AQ07 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tubb1A2AQ07 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tubb1A2AQ07 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tubb1A2AQ07 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tubb1A2AQ07 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tubb1A2AQ07 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tubb1A2AQ07 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tubb1A2AQ07 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tubb1A2AQ07 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tubb1A2AQ07 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tubb1A2AQ07 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tubb1A2AQ07 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tubb1A2AQ07 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tubb1A2AQ07 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tubb1A2AQ07 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tubb1A2AQ07 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tubb1A2AQ07 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tubb1A2AQ07 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tubb1A2AQ07 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tubb1A2AQ07 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tubb1A2AQ07 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tubb1A2AQ07 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tubb1A2AQ07 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tubb1A2AQ07 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tubb1A2AQ07 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tubb1A2AQ07 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tubb1A2AQ07 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tubb1A2AQ07 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tubb1A2AQ07 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tubb1A2AQ07 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tubb1A2AQ07 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tubb1A2AQ07 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tubb1A2AQ07 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tubb1A2AQ07 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tubb1A2AQ07 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tubb1A2AQ07 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tubb1A2AQ07 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tubb1A2AQ07 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tubb1A2AQ07 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tubb1A2AQ07 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tubb1A2AQ07 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tubb1A2AQ07 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tubb1A2AQ07 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tubb1A2AQ07 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tubb1A2AQ07 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tubb1A2AQ07 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubb1A2AQ07 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubb1A2AQ07 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubb1A2AQ07 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubb1A2AQ07 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubb1A2AQ07 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubb1A2AQ07 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tubb1A2AQ07 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tubb1A2AQ07 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tubb1A2AQ07 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tubb1A2AQ07 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tubb1A2AQ07 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tubb1A2AQ07 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tubb1A2AQ07 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tubb1A2AQ07 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tubb1A2AQ07 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tubb1A2AQ07 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tubb1A2AQ07 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tubb1A2AQ07 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tubb1A2AQ07 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tubb1A2AQ07 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tubb1A2AQ07 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Tubb1A2AQ07 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tubb1A2AQ07 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tubb1A2AQ07 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tubb1A2AQ07 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tubb1A2AQ07 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubb1A2AQ07 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubb1A2AQ07 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubb1A2AQ07 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms