Protein–RNA interactions for Protein: A2AIV2

Virma, Protein virilizer homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VirmaA2AIV2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
VirmaA2AIV2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
VirmaA2AIV2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
VirmaA2AIV2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
VirmaA2AIV2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
VirmaA2AIV2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
VirmaA2AIV2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
VirmaA2AIV2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
VirmaA2AIV2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
VirmaA2AIV2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
VirmaA2AIV2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
VirmaA2AIV2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
VirmaA2AIV2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
VirmaA2AIV2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
VirmaA2AIV2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
VirmaA2AIV2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
VirmaA2AIV2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
VirmaA2AIV2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
VirmaA2AIV2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
VirmaA2AIV2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
VirmaA2AIV2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
VirmaA2AIV2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
VirmaA2AIV2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
VirmaA2AIV2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
VirmaA2AIV2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
VirmaA2AIV2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
VirmaA2AIV2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
VirmaA2AIV2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
VirmaA2AIV2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
VirmaA2AIV2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
VirmaA2AIV2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
VirmaA2AIV2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
VirmaA2AIV2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
VirmaA2AIV2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
VirmaA2AIV2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
VirmaA2AIV2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
VirmaA2AIV2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
VirmaA2AIV2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
VirmaA2AIV2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
VirmaA2AIV2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
VirmaA2AIV2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
VirmaA2AIV2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
VirmaA2AIV2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
VirmaA2AIV2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
VirmaA2AIV2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
VirmaA2AIV2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
VirmaA2AIV2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
VirmaA2AIV2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
VirmaA2AIV2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
VirmaA2AIV2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
VirmaA2AIV2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
VirmaA2AIV2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
VirmaA2AIV2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
VirmaA2AIV2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
VirmaA2AIV2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
VirmaA2AIV2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
VirmaA2AIV2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
VirmaA2AIV2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
VirmaA2AIV2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
VirmaA2AIV2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
VirmaA2AIV2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
VirmaA2AIV2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
VirmaA2AIV2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
VirmaA2AIV2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
VirmaA2AIV2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
VirmaA2AIV2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
VirmaA2AIV2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
VirmaA2AIV2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
VirmaA2AIV2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
VirmaA2AIV2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
VirmaA2AIV2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
VirmaA2AIV2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
VirmaA2AIV2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
VirmaA2AIV2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
VirmaA2AIV2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
VirmaA2AIV2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
VirmaA2AIV2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
VirmaA2AIV2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
VirmaA2AIV2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
VirmaA2AIV2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
VirmaA2AIV2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
VirmaA2AIV2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
VirmaA2AIV2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
VirmaA2AIV2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
VirmaA2AIV2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
VirmaA2AIV2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
VirmaA2AIV2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
VirmaA2AIV2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
VirmaA2AIV2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
VirmaA2AIV2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
VirmaA2AIV2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
VirmaA2AIV2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
VirmaA2AIV2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
VirmaA2AIV2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
VirmaA2AIV2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
VirmaA2AIV2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
VirmaA2AIV2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
VirmaA2AIV2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
VirmaA2AIV2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
VirmaA2AIV2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms