Protein–RNA interactions for Protein: A2A6T1

Cdr2l, Cerebellar degeneration-related protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr2lA2A6T1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdr2lA2A6T1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdr2lA2A6T1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdr2lA2A6T1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdr2lA2A6T1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdr2lA2A6T1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdr2lA2A6T1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdr2lA2A6T1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdr2lA2A6T1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdr2lA2A6T1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdr2lA2A6T1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdr2lA2A6T1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdr2lA2A6T1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdr2lA2A6T1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdr2lA2A6T1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdr2lA2A6T1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdr2lA2A6T1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdr2lA2A6T1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdr2lA2A6T1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdr2lA2A6T1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdr2lA2A6T1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdr2lA2A6T1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdr2lA2A6T1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdr2lA2A6T1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdr2lA2A6T1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdr2lA2A6T1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdr2lA2A6T1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdr2lA2A6T1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdr2lA2A6T1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdr2lA2A6T1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdr2lA2A6T1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdr2lA2A6T1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdr2lA2A6T1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdr2lA2A6T1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdr2lA2A6T1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdr2lA2A6T1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdr2lA2A6T1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdr2lA2A6T1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdr2lA2A6T1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdr2lA2A6T1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdr2lA2A6T1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdr2lA2A6T1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdr2lA2A6T1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdr2lA2A6T1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdr2lA2A6T1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdr2lA2A6T1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdr2lA2A6T1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdr2lA2A6T1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdr2lA2A6T1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdr2lA2A6T1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdr2lA2A6T1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdr2lA2A6T1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdr2lA2A6T1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdr2lA2A6T1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdr2lA2A6T1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdr2lA2A6T1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdr2lA2A6T1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdr2lA2A6T1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdr2lA2A6T1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdr2lA2A6T1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdr2lA2A6T1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdr2lA2A6T1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdr2lA2A6T1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdr2lA2A6T1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdr2lA2A6T1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdr2lA2A6T1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdr2lA2A6T1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdr2lA2A6T1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdr2lA2A6T1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdr2lA2A6T1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdr2lA2A6T1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdr2lA2A6T1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdr2lA2A6T1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdr2lA2A6T1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdr2lA2A6T1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdr2lA2A6T1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdr2lA2A6T1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdr2lA2A6T1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdr2lA2A6T1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdr2lA2A6T1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdr2lA2A6T1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdr2lA2A6T1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdr2lA2A6T1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdr2lA2A6T1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdr2lA2A6T1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdr2lA2A6T1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdr2lA2A6T1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdr2lA2A6T1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdr2lA2A6T1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdr2lA2A6T1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdr2lA2A6T1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdr2lA2A6T1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdr2lA2A6T1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdr2lA2A6T1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdr2lA2A6T1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdr2lA2A6T1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdr2lA2A6T1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdr2lA2A6T1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdr2lA2A6T1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdr2lA2A6T1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.9 ms