Protein–RNA interactions for Protein: A1L3C1

Fam71e1, Protein FAM71E1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71e1A1L3C1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Fam71e1A1L3C1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Fam71e1A1L3C1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Fam71e1A1L3C1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Fam71e1A1L3C1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Fam71e1A1L3C1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Fam71e1A1L3C1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Fam71e1A1L3C1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Fam71e1A1L3C1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Fam71e1A1L3C1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Fam71e1A1L3C1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Fam71e1A1L3C1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Fam71e1A1L3C1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Fam71e1A1L3C1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Fam71e1A1L3C1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Fam71e1A1L3C1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Fam71e1A1L3C1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Fam71e1A1L3C1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Fam71e1A1L3C1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Fam71e1A1L3C1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Fam71e1A1L3C1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Fam71e1A1L3C1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Fam71e1A1L3C1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Fam71e1A1L3C1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Fam71e1A1L3C1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Fam71e1A1L3C1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Fam71e1A1L3C1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Fam71e1A1L3C1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Fam71e1A1L3C1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Fam71e1A1L3C1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Fam71e1A1L3C1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Fam71e1A1L3C1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Fam71e1A1L3C1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Fam71e1A1L3C1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Fam71e1A1L3C1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Fam71e1A1L3C1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Fam71e1A1L3C1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Fam71e1A1L3C1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Fam71e1A1L3C1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Fam71e1A1L3C1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Fam71e1A1L3C1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Fam71e1A1L3C1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Fam71e1A1L3C1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Fam71e1A1L3C1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Fam71e1A1L3C1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Fam71e1A1L3C1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Fam71e1A1L3C1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Fam71e1A1L3C1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Fam71e1A1L3C1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Fam71e1A1L3C1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Fam71e1A1L3C1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Fam71e1A1L3C1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Fam71e1A1L3C1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Fam71e1A1L3C1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Fam71e1A1L3C1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Fam71e1A1L3C1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Fam71e1A1L3C1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Fam71e1A1L3C1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Fam71e1A1L3C1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Fam71e1A1L3C1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Fam71e1A1L3C1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Fam71e1A1L3C1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Fam71e1A1L3C1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Fam71e1A1L3C1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Fam71e1A1L3C1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Fam71e1A1L3C1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Fam71e1A1L3C1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Fam71e1A1L3C1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Fam71e1A1L3C1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Fam71e1A1L3C1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Fam71e1A1L3C1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Fam71e1A1L3C1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Fam71e1A1L3C1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Fam71e1A1L3C1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Fam71e1A1L3C1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Fam71e1A1L3C1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Fam71e1A1L3C1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Fam71e1A1L3C1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Fam71e1A1L3C1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Fam71e1A1L3C1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Fam71e1A1L3C1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Fam71e1A1L3C1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Fam71e1A1L3C1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Fam71e1A1L3C1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Fam71e1A1L3C1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Fam71e1A1L3C1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Fam71e1A1L3C1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Fam71e1A1L3C1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Fam71e1A1L3C1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Fam71e1A1L3C1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Fam71e1A1L3C1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Fam71e1A1L3C1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Fam71e1A1L3C1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Fam71e1A1L3C1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Fam71e1A1L3C1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Fam71e1A1L3C1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Fam71e1A1L3C1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Fam71e1A1L3C1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Fam71e1A1L3C1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Fam71e1A1L3C1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms