Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYCE3A1L190 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYCE3A1L190 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYCE3A1L190 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYCE3A1L190 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYCE3A1L190 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYCE3A1L190 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYCE3A1L190 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYCE3A1L190 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYCE3A1L190 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYCE3A1L190 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYCE3A1L190 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYCE3A1L190 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYCE3A1L190 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYCE3A1L190 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYCE3A1L190 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYCE3A1L190 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYCE3A1L190 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYCE3A1L190 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYCE3A1L190 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SYCE3A1L190 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYCE3A1L190 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SYCE3A1L190 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYCE3A1L190 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYCE3A1L190 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SYCE3A1L190 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYCE3A1L190 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYCE3A1L190 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SYCE3A1L190 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SYCE3A1L190 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYCE3A1L190 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYCE3A1L190 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYCE3A1L190 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYCE3A1L190 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SYCE3A1L190 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYCE3A1L190 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYCE3A1L190 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYCE3A1L190 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYCE3A1L190 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYCE3A1L190 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYCE3A1L190 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYCE3A1L190 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYCE3A1L190 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYCE3A1L190 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYCE3A1L190 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYCE3A1L190 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYCE3A1L190 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SYCE3A1L190 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYCE3A1L190 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYCE3A1L190 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYCE3A1L190 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYCE3A1L190 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYCE3A1L190 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYCE3A1L190 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYCE3A1L190 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYCE3A1L190 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYCE3A1L190 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYCE3A1L190 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYCE3A1L190 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYCE3A1L190 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYCE3A1L190 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYCE3A1L190 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYCE3A1L190 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYCE3A1L190 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYCE3A1L190 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SYCE3A1L190 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYCE3A1L190 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYCE3A1L190 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SYCE3A1L190 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYCE3A1L190 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYCE3A1L190 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SYCE3A1L190 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYCE3A1L190 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SYCE3A1L190 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYCE3A1L190 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYCE3A1L190 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYCE3A1L190 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYCE3A1L190 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SYCE3A1L190 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SYCE3A1L190 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYCE3A1L190 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYCE3A1L190 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYCE3A1L190 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYCE3A1L190 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYCE3A1L190 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYCE3A1L190 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYCE3A1L190 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYCE3A1L190 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYCE3A1L190 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYCE3A1L190 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYCE3A1L190 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYCE3A1L190 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYCE3A1L190 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYCE3A1L190 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYCE3A1L190 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYCE3A1L190 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYCE3A1L190 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYCE3A1L190 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYCE3A1L190 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYCE3A1L190 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms