Protein–RNA interactions for Protein: A0PJW6

TMEM223, Transmembrane protein 223, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM223A0PJW6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM223A0PJW6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM223A0PJW6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM223A0PJW6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM223A0PJW6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM223A0PJW6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM223A0PJW6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM223A0PJW6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM223A0PJW6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM223A0PJW6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM223A0PJW6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM223A0PJW6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM223A0PJW6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM223A0PJW6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM223A0PJW6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM223A0PJW6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM223A0PJW6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM223A0PJW6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM223A0PJW6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM223A0PJW6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM223A0PJW6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM223A0PJW6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM223A0PJW6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM223A0PJW6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM223A0PJW6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM223A0PJW6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM223A0PJW6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM223A0PJW6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM223A0PJW6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM223A0PJW6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM223A0PJW6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM223A0PJW6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM223A0PJW6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM223A0PJW6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM223A0PJW6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM223A0PJW6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM223A0PJW6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM223A0PJW6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM223A0PJW6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM223A0PJW6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM223A0PJW6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM223A0PJW6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM223A0PJW6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM223A0PJW6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM223A0PJW6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM223A0PJW6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM223A0PJW6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM223A0PJW6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM223A0PJW6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM223A0PJW6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM223A0PJW6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM223A0PJW6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM223A0PJW6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM223A0PJW6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM223A0PJW6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM223A0PJW6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM223A0PJW6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM223A0PJW6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM223A0PJW6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM223A0PJW6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM223A0PJW6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM223A0PJW6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM223A0PJW6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM223A0PJW6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM223A0PJW6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM223A0PJW6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM223A0PJW6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM223A0PJW6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM223A0PJW6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM223A0PJW6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM223A0PJW6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM223A0PJW6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM223A0PJW6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM223A0PJW6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM223A0PJW6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMEM223A0PJW6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMEM223A0PJW6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM223A0PJW6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM223A0PJW6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM223A0PJW6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM223A0PJW6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM223A0PJW6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM223A0PJW6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM223A0PJW6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM223A0PJW6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM223A0PJW6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM223A0PJW6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM223A0PJW6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM223A0PJW6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM223A0PJW6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM223A0PJW6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM223A0PJW6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM223A0PJW6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM223A0PJW6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM223A0PJW6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM223A0PJW6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM223A0PJW6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM223A0PJW6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM223A0PJW6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM223A0PJW6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms