Protein–RNA interactions for Protein: A0JP26

POTEB3, POTE ankyrin domain family member B3, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEB3A0JP26 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
POTEB3A0JP26 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
POTEB3A0JP26 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
POTEB3A0JP26 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
POTEB3A0JP26 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
POTEB3A0JP26 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
POTEB3A0JP26 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
POTEB3A0JP26 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
POTEB3A0JP26 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
POTEB3A0JP26 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
POTEB3A0JP26 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
POTEB3A0JP26 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
POTEB3A0JP26 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
POTEB3A0JP26 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
POTEB3A0JP26 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
POTEB3A0JP26 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
POTEB3A0JP26 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
POTEB3A0JP26 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
POTEB3A0JP26 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
POTEB3A0JP26 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
POTEB3A0JP26 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
POTEB3A0JP26 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
POTEB3A0JP26 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
POTEB3A0JP26 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
POTEB3A0JP26 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
POTEB3A0JP26 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
POTEB3A0JP26 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
POTEB3A0JP26 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
POTEB3A0JP26 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
POTEB3A0JP26 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
POTEB3A0JP26 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
POTEB3A0JP26 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
POTEB3A0JP26 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
POTEB3A0JP26 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
POTEB3A0JP26 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
POTEB3A0JP26 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
POTEB3A0JP26 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
POTEB3A0JP26 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
POTEB3A0JP26 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
POTEB3A0JP26 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
POTEB3A0JP26 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
POTEB3A0JP26 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
POTEB3A0JP26 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
POTEB3A0JP26 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
POTEB3A0JP26 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
POTEB3A0JP26 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
POTEB3A0JP26 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
POTEB3A0JP26 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
POTEB3A0JP26 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
POTEB3A0JP26 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
POTEB3A0JP26 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
POTEB3A0JP26 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
POTEB3A0JP26 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
POTEB3A0JP26 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
POTEB3A0JP26 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
POTEB3A0JP26 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
POTEB3A0JP26 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
POTEB3A0JP26 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
POTEB3A0JP26 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
POTEB3A0JP26 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
POTEB3A0JP26 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
POTEB3A0JP26 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
POTEB3A0JP26 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
POTEB3A0JP26 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
POTEB3A0JP26 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
POTEB3A0JP26 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
POTEB3A0JP26 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
POTEB3A0JP26 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
POTEB3A0JP26 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
POTEB3A0JP26 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
POTEB3A0JP26 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
POTEB3A0JP26 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
POTEB3A0JP26 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
POTEB3A0JP26 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
POTEB3A0JP26 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
POTEB3A0JP26 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
POTEB3A0JP26 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
POTEB3A0JP26 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
POTEB3A0JP26 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
POTEB3A0JP26 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
POTEB3A0JP26 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
POTEB3A0JP26 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
POTEB3A0JP26 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
POTEB3A0JP26 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
POTEB3A0JP26 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
POTEB3A0JP26 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
POTEB3A0JP26 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
POTEB3A0JP26 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
POTEB3A0JP26 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
POTEB3A0JP26 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
POTEB3A0JP26 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
POTEB3A0JP26 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
POTEB3A0JP26 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
POTEB3A0JP26 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
POTEB3A0JP26 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
POTEB3A0JP26 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
POTEB3A0JP26 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
POTEB3A0JP26 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
POTEB3A0JP26 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
POTEB3A0JP26 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms