Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2P6U8

4932415D10Rik, RIKEN cDNA 4932415D10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 4,986 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
4932415D10RikA0A1W2P6U8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
4932415D10RikA0A1W2P6U8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4932415D10RikA0A1W2P6U8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
4932415D10RikA0A1W2P6U8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
4932415D10RikA0A1W2P6U8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
4932415D10RikA0A1W2P6U8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
4932415D10RikA0A1W2P6U8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4932415D10RikA0A1W2P6U8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
4932415D10RikA0A1W2P6U8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4932415D10RikA0A1W2P6U8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
4932415D10RikA0A1W2P6U8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 186.4 ms