Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
1700028J19RikA0A0U1RP08 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
1700028J19RikA0A0U1RP08 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700028J19RikA0A0U1RP08 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700028J19RikA0A0U1RP08 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
1700028J19RikA0A0U1RP08 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700028J19RikA0A0U1RP08 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
1700028J19RikA0A0U1RP08 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
1700028J19RikA0A0U1RP08 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
1700028J19RikA0A0U1RP08 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
1700028J19RikA0A0U1RP08 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
1700028J19RikA0A0U1RP08 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
1700028J19RikA0A0U1RP08 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
1700028J19RikA0A0U1RP08 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
1700028J19RikA0A0U1RP08 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
1700028J19RikA0A0U1RP08 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
1700028J19RikA0A0U1RP08 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
1700028J19RikA0A0U1RP08 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms