Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWF9

TRBV2, T-cell receptor beta variable 2 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV2A0A0J9YWF9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRBV2A0A0J9YWF9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRBV2A0A0J9YWF9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRBV2A0A0J9YWF9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRBV2A0A0J9YWF9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRBV2A0A0J9YWF9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRBV2A0A0J9YWF9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRBV2A0A0J9YWF9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRBV2A0A0J9YWF9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRBV2A0A0J9YWF9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TRBV2A0A0J9YWF9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRBV2A0A0J9YWF9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TRBV2A0A0J9YWF9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TRBV2A0A0J9YWF9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRBV2A0A0J9YWF9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRBV2A0A0J9YWF9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRBV2A0A0J9YWF9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRBV2A0A0J9YWF9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRBV2A0A0J9YWF9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRBV2A0A0J9YWF9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRBV2A0A0J9YWF9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRBV2A0A0J9YWF9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRBV2A0A0J9YWF9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRBV2A0A0J9YWF9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRBV2A0A0J9YWF9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRBV2A0A0J9YWF9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRBV2A0A0J9YWF9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRBV2A0A0J9YWF9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRBV2A0A0J9YWF9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRBV2A0A0J9YWF9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRBV2A0A0J9YWF9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRBV2A0A0J9YWF9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRBV2A0A0J9YWF9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRBV2A0A0J9YWF9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TRBV2A0A0J9YWF9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRBV2A0A0J9YWF9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRBV2A0A0J9YWF9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRBV2A0A0J9YWF9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRBV2A0A0J9YWF9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TRBV2A0A0J9YWF9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TRBV2A0A0J9YWF9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRBV2A0A0J9YWF9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRBV2A0A0J9YWF9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRBV2A0A0J9YWF9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRBV2A0A0J9YWF9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRBV2A0A0J9YWF9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRBV2A0A0J9YWF9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRBV2A0A0J9YWF9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRBV2A0A0J9YWF9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRBV2A0A0J9YWF9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRBV2A0A0J9YWF9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRBV2A0A0J9YWF9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRBV2A0A0J9YWF9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRBV2A0A0J9YWF9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRBV2A0A0J9YWF9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRBV2A0A0J9YWF9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRBV2A0A0J9YWF9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRBV2A0A0J9YWF9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRBV2A0A0J9YWF9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRBV2A0A0J9YWF9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRBV2A0A0J9YWF9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRBV2A0A0J9YWF9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRBV2A0A0J9YWF9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRBV2A0A0J9YWF9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRBV2A0A0J9YWF9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRBV2A0A0J9YWF9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRBV2A0A0J9YWF9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRBV2A0A0J9YWF9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRBV2A0A0J9YWF9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRBV2A0A0J9YWF9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRBV2A0A0J9YWF9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRBV2A0A0J9YWF9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRBV2A0A0J9YWF9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRBV2A0A0J9YWF9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRBV2A0A0J9YWF9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRBV2A0A0J9YWF9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRBV2A0A0J9YWF9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRBV2A0A0J9YWF9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRBV2A0A0J9YWF9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRBV2A0A0J9YWF9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRBV2A0A0J9YWF9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRBV2A0A0J9YWF9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRBV2A0A0J9YWF9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRBV2A0A0J9YWF9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TRBV2A0A0J9YWF9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRBV2A0A0J9YWF9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRBV2A0A0J9YWF9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRBV2A0A0J9YWF9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRBV2A0A0J9YWF9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBV2A0A0J9YWF9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBV2A0A0J9YWF9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBV2A0A0J9YWF9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBV2A0A0J9YWF9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBV2A0A0J9YWF9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBV2A0A0J9YWF9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBV2A0A0J9YWF9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRBV2A0A0J9YWF9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRBV2A0A0J9YWF9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRBV2A0A0J9YWF9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRBV2A0A0J9YWF9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms