Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1R7

BORCS7-ASMT, BORCS7-ASMT readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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