Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WUJ7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WUJ7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A087WUJ7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A087WUJ7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A087WUJ7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A087WUJ7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A087WUJ7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A087WUJ7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A087WUJ7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A087WUJ7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A087WUJ7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A087WUJ7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
A0A087WUJ7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
A0A087WUJ7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A087WUJ7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A087WUJ7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A087WUJ7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A087WUJ7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A087WUJ7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A087WUJ7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A087WUJ7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A087WUJ7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A087WUJ7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A087WUJ7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A087WUJ7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A087WUJ7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A087WUJ7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A087WUJ7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A087WUJ7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A087WUJ7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A087WUJ7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A087WUJ7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A087WUJ7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A087WUJ7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A087WUJ7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A087WUJ7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A087WUJ7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A087WUJ7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A087WUJ7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A087WUJ7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A087WUJ7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A087WUJ7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A087WUJ7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A087WUJ7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A087WUJ7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A087WUJ7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A087WUJ7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A087WUJ7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A087WUJ7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A087WUJ7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A087WUJ7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A087WUJ7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A087WUJ7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A087WUJ7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A087WUJ7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A087WUJ7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A087WUJ7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A087WUJ7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A087WUJ7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A087WUJ7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A087WUJ7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A087WUJ7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A087WUJ7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A087WUJ7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A087WUJ7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A087WUJ7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A087WUJ7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A087WUJ7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A087WUJ7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A087WUJ7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A087WUJ7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A087WUJ7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A087WUJ7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A087WUJ7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A087WUJ7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A087WUJ7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A087WUJ7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A087WUJ7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A087WUJ7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A087WUJ7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A087WUJ7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A087WUJ7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A087WUJ7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A087WUJ7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A087WUJ7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A087WUJ7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A087WUJ7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A087WUJ7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A087WUJ7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A087WUJ7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A087WUJ7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A087WUJ7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A087WUJ7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A087WUJ7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A087WUJ7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A087WUJ7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A087WUJ7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A087WUJ7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A087WUJ7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A087WUJ7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A087WUJ7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms