Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WP46

BC034090, cDNA sequence BC034090, mousemouse

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Length 1,202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC034090A0A087WP46 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BC034090A0A087WP46 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BC034090A0A087WP46 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BC034090A0A087WP46 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BC034090A0A087WP46 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BC034090A0A087WP46 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BC034090A0A087WP46 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BC034090A0A087WP46 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BC034090A0A087WP46 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BC034090A0A087WP46 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BC034090A0A087WP46 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BC034090A0A087WP46 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BC034090A0A087WP46 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BC034090A0A087WP46 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BC034090A0A087WP46 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BC034090A0A087WP46 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BC034090A0A087WP46 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BC034090A0A087WP46 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BC034090A0A087WP46 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BC034090A0A087WP46 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BC034090A0A087WP46 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BC034090A0A087WP46 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BC034090A0A087WP46 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BC034090A0A087WP46 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BC034090A0A087WP46 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BC034090A0A087WP46 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BC034090A0A087WP46 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BC034090A0A087WP46 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BC034090A0A087WP46 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BC034090A0A087WP46 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BC034090A0A087WP46 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BC034090A0A087WP46 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BC034090A0A087WP46 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BC034090A0A087WP46 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BC034090A0A087WP46 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BC034090A0A087WP46 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BC034090A0A087WP46 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BC034090A0A087WP46 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BC034090A0A087WP46 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BC034090A0A087WP46 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BC034090A0A087WP46 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BC034090A0A087WP46 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BC034090A0A087WP46 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BC034090A0A087WP46 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BC034090A0A087WP46 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BC034090A0A087WP46 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BC034090A0A087WP46 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BC034090A0A087WP46 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BC034090A0A087WP46 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BC034090A0A087WP46 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BC034090A0A087WP46 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BC034090A0A087WP46 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BC034090A0A087WP46 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BC034090A0A087WP46 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BC034090A0A087WP46 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BC034090A0A087WP46 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BC034090A0A087WP46 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BC034090A0A087WP46 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BC034090A0A087WP46 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BC034090A0A087WP46 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BC034090A0A087WP46 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BC034090A0A087WP46 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BC034090A0A087WP46 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BC034090A0A087WP46 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BC034090A0A087WP46 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BC034090A0A087WP46 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BC034090A0A087WP46 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BC034090A0A087WP46 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BC034090A0A087WP46 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BC034090A0A087WP46 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BC034090A0A087WP46 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BC034090A0A087WP46 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BC034090A0A087WP46 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BC034090A0A087WP46 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BC034090A0A087WP46 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BC034090A0A087WP46 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
BC034090A0A087WP46 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BC034090A0A087WP46 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BC034090A0A087WP46 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BC034090A0A087WP46 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BC034090A0A087WP46 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BC034090A0A087WP46 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BC034090A0A087WP46 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BC034090A0A087WP46 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BC034090A0A087WP46 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BC034090A0A087WP46 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BC034090A0A087WP46 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BC034090A0A087WP46 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BC034090A0A087WP46 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BC034090A0A087WP46 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BC034090A0A087WP46 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BC034090A0A087WP46 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BC034090A0A087WP46 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BC034090A0A087WP46 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BC034090A0A087WP46 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BC034090A0A087WP46 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BC034090A0A087WP46 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BC034090A0A087WP46 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BC034090A0A087WP46 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BC034090A0A087WP46 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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