Protein–RNA interactions for Protein: F8VPJ6

Rfx7, Regulatory factor X, 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx7F8VPJ6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rfx7F8VPJ6 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rfx7F8VPJ6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.5 ms