Protein–RNA interactions for Protein: Q7M732

Rtl1, Retrotransposon-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl1Q7M732 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rtl1Q7M732 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rtl1Q7M732 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rtl1Q7M732 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rtl1Q7M732 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rtl1Q7M732 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rtl1Q7M732 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Rtl1Q7M732 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rtl1Q7M732 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rtl1Q7M732 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rtl1Q7M732 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Rtl1Q7M732 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rtl1Q7M732 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rtl1Q7M732 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rtl1Q7M732 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rtl1Q7M732 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rtl1Q7M732 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Rtl1Q7M732 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rtl1Q7M732 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rtl1Q7M732 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rtl1Q7M732 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rtl1Q7M732 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rtl1Q7M732 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rtl1Q7M732 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rtl1Q7M732 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rtl1Q7M732 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Rtl1Q7M732 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rtl1Q7M732 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rtl1Q7M732 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rtl1Q7M732 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rtl1Q7M732 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Rtl1Q7M732 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rtl1Q7M732 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rtl1Q7M732 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rtl1Q7M732 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Rtl1Q7M732 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Rtl1Q7M732 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Rtl1Q7M732 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rtl1Q7M732 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rtl1Q7M732 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Rtl1Q7M732 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Rtl1Q7M732 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rtl1Q7M732 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Rtl1Q7M732 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rtl1Q7M732 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Rtl1Q7M732 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Rtl1Q7M732 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rtl1Q7M732 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Rtl1Q7M732 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rtl1Q7M732 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rtl1Q7M732 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rtl1Q7M732 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rtl1Q7M732 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rtl1Q7M732 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Rtl1Q7M732 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Rtl1Q7M732 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Rtl1Q7M732 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Rtl1Q7M732 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Rtl1Q7M732 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Rtl1Q7M732 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rtl1Q7M732 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rtl1Q7M732 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rtl1Q7M732 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Rtl1Q7M732 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Rtl1Q7M732 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rtl1Q7M732 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rtl1Q7M732 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rtl1Q7M732 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rtl1Q7M732 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rtl1Q7M732 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Rtl1Q7M732 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rtl1Q7M732 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rtl1Q7M732 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rtl1Q7M732 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Rtl1Q7M732 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rtl1Q7M732 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rtl1Q7M732 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rtl1Q7M732 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Rtl1Q7M732 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rtl1Q7M732 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rtl1Q7M732 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rtl1Q7M732 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Rtl1Q7M732 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rtl1Q7M732 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rtl1Q7M732 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rtl1Q7M732 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Rtl1Q7M732 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Rtl1Q7M732 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Rtl1Q7M732 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rtl1Q7M732 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Rtl1Q7M732 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rtl1Q7M732 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rtl1Q7M732 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rtl1Q7M732 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rtl1Q7M732 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rtl1Q7M732 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rtl1Q7M732 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rtl1Q7M732 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rtl1Q7M732 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Rtl1Q7M732 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms