Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RhoP15409 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RhoP15409 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhoP15409 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhoP15409 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhoP15409 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhoP15409 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhoP15409 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhoP15409 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhoP15409 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RhoP15409 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RhoP15409 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RhoP15409 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RhoP15409 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RhoP15409 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RhoP15409 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RhoP15409 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RhoP15409 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RhoP15409 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RhoP15409 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RhoP15409 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RhoP15409 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RhoP15409 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RhoP15409 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RhoP15409 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RhoP15409 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RhoP15409 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RhoP15409 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RhoP15409 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RhoP15409 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RhoP15409 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RhoP15409 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RhoP15409 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RhoP15409 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RhoP15409 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RhoP15409 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RhoP15409 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RhoP15409 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RhoP15409 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RhoP15409 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
RhoP15409 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RhoP15409 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RhoP15409 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RhoP15409 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RhoP15409 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RhoP15409 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RhoP15409 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RhoP15409 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RhoP15409 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RhoP15409 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RhoP15409 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RhoP15409 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RhoP15409 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RhoP15409 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RhoP15409 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RhoP15409 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RhoP15409 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RhoP15409 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RhoP15409 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RhoP15409 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RhoP15409 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RhoP15409 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RhoP15409 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RhoP15409 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RhoP15409 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RhoP15409 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RhoP15409 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RhoP15409 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RhoP15409 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RhoP15409 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RhoP15409 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhoP15409 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhoP15409 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhoP15409 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhoP15409 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhoP15409 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhoP15409 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RhoP15409 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhoP15409 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhoP15409 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhoP15409 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhoP15409 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhoP15409 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhoP15409 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhoP15409 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhoP15409 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhoP15409 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhoP15409 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhoP15409 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RhoP15409 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RhoP15409 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhoP15409 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhoP15409 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhoP15409 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RhoP15409 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhoP15409 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhoP15409 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhoP15409 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhoP15409 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhoP15409 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms