Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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NipblQ6KCD5 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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NipblQ6KCD5 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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NipblQ6KCD5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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NipblQ6KCD5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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NipblQ6KCD5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NipblQ6KCD5 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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