Protein–RNA interactions for Protein: P09405

Ncl, Nucleolin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NclP09405 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NclP09405 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NclP09405 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NclP09405 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NclP09405 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NclP09405 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NclP09405 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NclP09405 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NclP09405 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NclP09405 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NclP09405 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NclP09405 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NclP09405 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NclP09405 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NclP09405 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NclP09405 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NclP09405 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NclP09405 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NclP09405 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NclP09405 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NclP09405 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NclP09405 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NclP09405 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NclP09405 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NclP09405 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NclP09405 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NclP09405 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NclP09405 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NclP09405 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NclP09405 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NclP09405 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NclP09405 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NclP09405 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NclP09405 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NclP09405 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NclP09405 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NclP09405 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NclP09405 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NclP09405 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NclP09405 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NclP09405 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NclP09405 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NclP09405 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NclP09405 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NclP09405 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NclP09405 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NclP09405 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NclP09405 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NclP09405 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NclP09405 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NclP09405 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NclP09405 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NclP09405 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NclP09405 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NclP09405 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NclP09405 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NclP09405 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NclP09405 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NclP09405 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NclP09405 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NclP09405 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NclP09405 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NclP09405 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NclP09405 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NclP09405 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NclP09405 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NclP09405 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NclP09405 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NclP09405 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NclP09405 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NclP09405 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NclP09405 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NclP09405 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NclP09405 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NclP09405 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NclP09405 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NclP09405 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NclP09405 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NclP09405 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NclP09405 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NclP09405 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NclP09405 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NclP09405 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NclP09405 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NclP09405 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NclP09405 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NclP09405 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NclP09405 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NclP09405 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NclP09405 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NclP09405 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NclP09405 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NclP09405 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NclP09405 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NclP09405 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NclP09405 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NclP09405 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NclP09405 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NclP09405 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NclP09405 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms