Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
NipblQ6KCD5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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NipblQ6KCD5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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NipblQ6KCD5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NipblQ6KCD5 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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