Protein–RNA interactions for Protein: P41230

Kdm5c, Lysine-specific demethylase 5C, mousemouse

Predictions only

Length 1,554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5cP41230 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5cP41230 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm5cP41230 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms