Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxb3P09026 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb3P09026 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb3P09026 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb3P09026 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb3P09026 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb3P09026 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb3P09026 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb3P09026 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb3P09026 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb3P09026 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb3P09026 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb3P09026 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb3P09026 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb3P09026 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb3P09026 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb3P09026 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb3P09026 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb3P09026 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb3P09026 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb3P09026 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb3P09026 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb3P09026 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb3P09026 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb3P09026 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb3P09026 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb3P09026 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb3P09026 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb3P09026 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb3P09026 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb3P09026 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb3P09026 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb3P09026 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb3P09026 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb3P09026 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb3P09026 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb3P09026 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb3P09026 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb3P09026 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb3P09026 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb3P09026 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb3P09026 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb3P09026 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb3P09026 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxb3P09026 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxb3P09026 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxb3P09026 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxb3P09026 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxb3P09026 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxb3P09026 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxb3P09026 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb3P09026 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 154.5 ms