Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIP3

4933424G06Rik, RIKEN cDNA 4933424G06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933424G06RikA0A140LIP3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4933424G06RikA0A140LIP3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms