Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gps1Q99LD4 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms