Protein–RNA interactions for Protein: P59997

Kdm2a, Lysine-specific demethylase 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2aP59997 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm2aP59997 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Kdm2aP59997 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm2aP59997 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm2aP59997 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm2aP59997 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm2aP59997 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm2aP59997 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm2aP59997 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm2aP59997 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm2aP59997 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm2aP59997 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm2aP59997 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm2aP59997 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm2aP59997 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm2aP59997 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm2aP59997 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm2aP59997 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm2aP59997 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm2aP59997 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm2aP59997 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm2aP59997 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm2aP59997 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm2aP59997 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm2aP59997 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm2aP59997 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm2aP59997 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm2aP59997 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm2aP59997 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm2aP59997 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm2aP59997 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm2aP59997 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm2aP59997 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm2aP59997 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Kdm2aP59997 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Kdm2aP59997 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm2aP59997 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm2aP59997 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm2aP59997 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm2aP59997 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm2aP59997 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms