Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms