Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb3P09026 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxb3P09026 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms