Protein–RNA interactions for Protein: V9GYQ6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYQ6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
V9GYQ6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
V9GYQ6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
V9GYQ6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
V9GYQ6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
V9GYQ6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
V9GYQ6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
V9GYQ6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
V9GYQ6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
V9GYQ6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
V9GYQ6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
V9GYQ6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
V9GYQ6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
V9GYQ6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
V9GYQ6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
V9GYQ6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
V9GYQ6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
V9GYQ6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
V9GYQ6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
V9GYQ6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
V9GYQ6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
V9GYQ6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
V9GYQ6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
V9GYQ6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
V9GYQ6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
V9GYQ6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
V9GYQ6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
V9GYQ6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
V9GYQ6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
V9GYQ6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
V9GYQ6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
V9GYQ6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
V9GYQ6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
V9GYQ6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
V9GYQ6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
V9GYQ6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
V9GYQ6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
V9GYQ6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
V9GYQ6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
V9GYQ6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
V9GYQ6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
V9GYQ6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
V9GYQ6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
V9GYQ6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
V9GYQ6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
V9GYQ6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
V9GYQ6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
V9GYQ6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
V9GYQ6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
V9GYQ6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
V9GYQ6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
V9GYQ6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
V9GYQ6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
V9GYQ6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
V9GYQ6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
V9GYQ6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
V9GYQ6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
V9GYQ6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
V9GYQ6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
V9GYQ6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
V9GYQ6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
V9GYQ6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
V9GYQ6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
V9GYQ6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
V9GYQ6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
V9GYQ6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
V9GYQ6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
V9GYQ6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
V9GYQ6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
V9GYQ6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
V9GYQ6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
V9GYQ6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
V9GYQ6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
V9GYQ6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
V9GYQ6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
V9GYQ6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
V9GYQ6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
V9GYQ6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
V9GYQ6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
V9GYQ6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
V9GYQ6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
V9GYQ6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
V9GYQ6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
V9GYQ6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
V9GYQ6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
V9GYQ6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
V9GYQ6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
V9GYQ6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
V9GYQ6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
V9GYQ6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
V9GYQ6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
V9GYQ6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
V9GYQ6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
V9GYQ6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
V9GYQ6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
V9GYQ6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
V9GYQ6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
V9GYQ6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
V9GYQ6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
V9GYQ6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.3 ms