Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ARL2-SNX15V9GYD0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ARL2-SNX15V9GYD0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ARL2-SNX15V9GYD0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ARL2-SNX15V9GYD0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ARL2-SNX15V9GYD0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ARL2-SNX15V9GYD0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ARL2-SNX15V9GYD0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ARL2-SNX15V9GYD0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ARL2-SNX15V9GYD0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ARL2-SNX15V9GYD0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ARL2-SNX15V9GYD0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
ARL2-SNX15V9GYD0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ARL2-SNX15V9GYD0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ARL2-SNX15V9GYD0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
ARL2-SNX15V9GYD0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ARL2-SNX15V9GYD0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ARL2-SNX15V9GYD0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ARL2-SNX15V9GYD0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
ARL2-SNX15V9GYD0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ARL2-SNX15V9GYD0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ARL2-SNX15V9GYD0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ARL2-SNX15V9GYD0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ARL2-SNX15V9GYD0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ARL2-SNX15V9GYD0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ARL2-SNX15V9GYD0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ARL2-SNX15V9GYD0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ARL2-SNX15V9GYD0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ARL2-SNX15V9GYD0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ARL2-SNX15V9GYD0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ARL2-SNX15V9GYD0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ARL2-SNX15V9GYD0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ARL2-SNX15V9GYD0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ARL2-SNX15V9GYD0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ARL2-SNX15V9GYD0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ARL2-SNX15V9GYD0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ARL2-SNX15V9GYD0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ARL2-SNX15V9GYD0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ARL2-SNX15V9GYD0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ARL2-SNX15V9GYD0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ARL2-SNX15V9GYD0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ARL2-SNX15V9GYD0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ARL2-SNX15V9GYD0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ARL2-SNX15V9GYD0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ARL2-SNX15V9GYD0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ARL2-SNX15V9GYD0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ARL2-SNX15V9GYD0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARL2-SNX15V9GYD0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARL2-SNX15V9GYD0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ARL2-SNX15V9GYD0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARL2-SNX15V9GYD0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARL2-SNX15V9GYD0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARL2-SNX15V9GYD0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARL2-SNX15V9GYD0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ARL2-SNX15V9GYD0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ARL2-SNX15V9GYD0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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ARL2-SNX15V9GYD0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ARL2-SNX15V9GYD0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ARL2-SNX15V9GYD0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ARL2-SNX15V9GYD0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ARL2-SNX15V9GYD0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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ARL2-SNX15V9GYD0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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ARL2-SNX15V9GYD0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ARL2-SNX15V9GYD0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ARL2-SNX15V9GYD0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ARL2-SNX15V9GYD0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ARL2-SNX15V9GYD0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ARL2-SNX15V9GYD0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ARL2-SNX15V9GYD0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ARL2-SNX15V9GYD0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ARL2-SNX15V9GYD0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ARL2-SNX15V9GYD0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ARL2-SNX15V9GYD0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ARL2-SNX15V9GYD0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ARL2-SNX15V9GYD0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARL2-SNX15V9GYD0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARL2-SNX15V9GYD0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARL2-SNX15V9GYD0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARL2-SNX15V9GYD0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARL2-SNX15V9GYD0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARL2-SNX15V9GYD0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARL2-SNX15V9GYD0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARL2-SNX15V9GYD0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARL2-SNX15V9GYD0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARL2-SNX15V9GYD0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
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