Protein–RNA interactions for Protein: S4R2K0

Pdf, Peptide deformylase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdfS4R2K0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PdfS4R2K0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PdfS4R2K0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PdfS4R2K0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PdfS4R2K0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PdfS4R2K0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PdfS4R2K0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PdfS4R2K0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PdfS4R2K0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PdfS4R2K0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PdfS4R2K0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PdfS4R2K0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PdfS4R2K0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PdfS4R2K0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PdfS4R2K0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PdfS4R2K0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PdfS4R2K0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PdfS4R2K0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PdfS4R2K0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PdfS4R2K0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PdfS4R2K0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PdfS4R2K0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PdfS4R2K0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PdfS4R2K0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PdfS4R2K0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PdfS4R2K0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdfS4R2K0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdfS4R2K0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdfS4R2K0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdfS4R2K0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdfS4R2K0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdfS4R2K0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdfS4R2K0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdfS4R2K0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdfS4R2K0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PdfS4R2K0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PdfS4R2K0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PdfS4R2K0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PdfS4R2K0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PdfS4R2K0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PdfS4R2K0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PdfS4R2K0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PdfS4R2K0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PdfS4R2K0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PdfS4R2K0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PdfS4R2K0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PdfS4R2K0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PdfS4R2K0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PdfS4R2K0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PdfS4R2K0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PdfS4R2K0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PdfS4R2K0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PdfS4R2K0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PdfS4R2K0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PdfS4R2K0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PdfS4R2K0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PdfS4R2K0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PdfS4R2K0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PdfS4R2K0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PdfS4R2K0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PdfS4R2K0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PdfS4R2K0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PdfS4R2K0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PdfS4R2K0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PdfS4R2K0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PdfS4R2K0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PdfS4R2K0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PdfS4R2K0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PdfS4R2K0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PdfS4R2K0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PdfS4R2K0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PdfS4R2K0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PdfS4R2K0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PdfS4R2K0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PdfS4R2K0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PdfS4R2K0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PdfS4R2K0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PdfS4R2K0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PdfS4R2K0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PdfS4R2K0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PdfS4R2K0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PdfS4R2K0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PdfS4R2K0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PdfS4R2K0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PdfS4R2K0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PdfS4R2K0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PdfS4R2K0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PdfS4R2K0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PdfS4R2K0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PdfS4R2K0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PdfS4R2K0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PdfS4R2K0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PdfS4R2K0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PdfS4R2K0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PdfS4R2K0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PdfS4R2K0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PdfS4R2K0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PdfS4R2K0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PdfS4R2K0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PdfS4R2K0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms