Protein–RNA interactions for Protein: R4GNA1

MINOS1-NBL1, MICOS complex subunit MIC10 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINOS1-NBL1R4GNA1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MINOS1-NBL1R4GNA1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MINOS1-NBL1R4GNA1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MINOS1-NBL1R4GNA1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MINOS1-NBL1R4GNA1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MINOS1-NBL1R4GNA1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MINOS1-NBL1R4GNA1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MINOS1-NBL1R4GNA1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MINOS1-NBL1R4GNA1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MINOS1-NBL1R4GNA1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MINOS1-NBL1R4GNA1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MINOS1-NBL1R4GNA1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MINOS1-NBL1R4GNA1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MINOS1-NBL1R4GNA1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MINOS1-NBL1R4GNA1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MINOS1-NBL1R4GNA1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MINOS1-NBL1R4GNA1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MINOS1-NBL1R4GNA1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MINOS1-NBL1R4GNA1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MINOS1-NBL1R4GNA1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MINOS1-NBL1R4GNA1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MINOS1-NBL1R4GNA1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MINOS1-NBL1R4GNA1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MINOS1-NBL1R4GNA1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MINOS1-NBL1R4GNA1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MINOS1-NBL1R4GNA1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MINOS1-NBL1R4GNA1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MINOS1-NBL1R4GNA1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MINOS1-NBL1R4GNA1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MINOS1-NBL1R4GNA1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MINOS1-NBL1R4GNA1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MINOS1-NBL1R4GNA1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MINOS1-NBL1R4GNA1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MINOS1-NBL1R4GNA1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MINOS1-NBL1R4GNA1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MINOS1-NBL1R4GNA1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MINOS1-NBL1R4GNA1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MINOS1-NBL1R4GNA1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MINOS1-NBL1R4GNA1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MINOS1-NBL1R4GNA1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MINOS1-NBL1R4GNA1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MINOS1-NBL1R4GNA1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MINOS1-NBL1R4GNA1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MINOS1-NBL1R4GNA1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MINOS1-NBL1R4GNA1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MINOS1-NBL1R4GNA1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MINOS1-NBL1R4GNA1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MINOS1-NBL1R4GNA1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MINOS1-NBL1R4GNA1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MINOS1-NBL1R4GNA1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MINOS1-NBL1R4GNA1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MINOS1-NBL1R4GNA1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MINOS1-NBL1R4GNA1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
MINOS1-NBL1R4GNA1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MINOS1-NBL1R4GNA1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MINOS1-NBL1R4GNA1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MINOS1-NBL1R4GNA1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MINOS1-NBL1R4GNA1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MINOS1-NBL1R4GNA1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MINOS1-NBL1R4GNA1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MINOS1-NBL1R4GNA1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MINOS1-NBL1R4GNA1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MINOS1-NBL1R4GNA1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MINOS1-NBL1R4GNA1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MINOS1-NBL1R4GNA1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MINOS1-NBL1R4GNA1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MINOS1-NBL1R4GNA1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MINOS1-NBL1R4GNA1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MINOS1-NBL1R4GNA1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MINOS1-NBL1R4GNA1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MINOS1-NBL1R4GNA1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MINOS1-NBL1R4GNA1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
MINOS1-NBL1R4GNA1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MINOS1-NBL1R4GNA1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MINOS1-NBL1R4GNA1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MINOS1-NBL1R4GNA1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MINOS1-NBL1R4GNA1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MINOS1-NBL1R4GNA1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MINOS1-NBL1R4GNA1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MINOS1-NBL1R4GNA1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MINOS1-NBL1R4GNA1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MINOS1-NBL1R4GNA1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MINOS1-NBL1R4GNA1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MINOS1-NBL1R4GNA1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MINOS1-NBL1R4GNA1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MINOS1-NBL1R4GNA1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MINOS1-NBL1R4GNA1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
MINOS1-NBL1R4GNA1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MINOS1-NBL1R4GNA1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MINOS1-NBL1R4GNA1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MINOS1-NBL1R4GNA1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MINOS1-NBL1R4GNA1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MINOS1-NBL1R4GNA1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MINOS1-NBL1R4GNA1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms