Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vamp5Q9Z2P8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vamp5Q9Z2P8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vamp5Q9Z2P8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vamp5Q9Z2P8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vamp5Q9Z2P8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vamp5Q9Z2P8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vamp5Q9Z2P8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vamp5Q9Z2P8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vamp5Q9Z2P8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vamp5Q9Z2P8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vamp5Q9Z2P8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vamp5Q9Z2P8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vamp5Q9Z2P8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vamp5Q9Z2P8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vamp5Q9Z2P8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vamp5Q9Z2P8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vamp5Q9Z2P8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vamp5Q9Z2P8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vamp5Q9Z2P8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp5Q9Z2P8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp5Q9Z2P8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp5Q9Z2P8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp5Q9Z2P8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp5Q9Z2P8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp5Q9Z2P8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp5Q9Z2P8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp5Q9Z2P8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp5Q9Z2P8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp5Q9Z2P8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp5Q9Z2P8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vamp5Q9Z2P8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Vamp5Q9Z2P8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vamp5Q9Z2P8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vamp5Q9Z2P8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vamp5Q9Z2P8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vamp5Q9Z2P8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vamp5Q9Z2P8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vamp5Q9Z2P8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vamp5Q9Z2P8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vamp5Q9Z2P8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp5Q9Z2P8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp5Q9Z2P8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp5Q9Z2P8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp5Q9Z2P8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp5Q9Z2P8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp5Q9Z2P8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp5Q9Z2P8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp5Q9Z2P8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp5Q9Z2P8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp5Q9Z2P8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp5Q9Z2P8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp5Q9Z2P8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp5Q9Z2P8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp5Q9Z2P8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp5Q9Z2P8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp5Q9Z2P8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp5Q9Z2P8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp5Q9Z2P8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp5Q9Z2P8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp5Q9Z2P8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp5Q9Z2P8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp5Q9Z2P8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp5Q9Z2P8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp5Q9Z2P8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vamp5Q9Z2P8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vamp5Q9Z2P8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vamp5Q9Z2P8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vamp5Q9Z2P8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Vamp5Q9Z2P8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vamp5Q9Z2P8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp5Q9Z2P8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp5Q9Z2P8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp5Q9Z2P8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vamp5Q9Z2P8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vamp5Q9Z2P8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vamp5Q9Z2P8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vamp5Q9Z2P8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vamp5Q9Z2P8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vamp5Q9Z2P8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vamp5Q9Z2P8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vamp5Q9Z2P8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vamp5Q9Z2P8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vamp5Q9Z2P8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vamp5Q9Z2P8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vamp5Q9Z2P8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vamp5Q9Z2P8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vamp5Q9Z2P8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vamp5Q9Z2P8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vamp5Q9Z2P8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vamp5Q9Z2P8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vamp5Q9Z2P8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vamp5Q9Z2P8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vamp5Q9Z2P8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vamp5Q9Z2P8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vamp5Q9Z2P8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vamp5Q9Z2P8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vamp5Q9Z2P8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vamp5Q9Z2P8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vamp5Q9Z2P8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms