Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rps6ka4Q9Z2B9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Rps6ka4Q9Z2B9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rps6ka4Q9Z2B9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rps6ka4Q9Z2B9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rps6ka4Q9Z2B9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rps6ka4Q9Z2B9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rps6ka4Q9Z2B9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Rps6ka4Q9Z2B9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rps6ka4Q9Z2B9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rps6ka4Q9Z2B9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rps6ka4Q9Z2B9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rps6ka4Q9Z2B9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rps6ka4Q9Z2B9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rps6ka4Q9Z2B9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rps6ka4Q9Z2B9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rps6ka4Q9Z2B9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rps6ka4Q9Z2B9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rps6ka4Q9Z2B9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rps6ka4Q9Z2B9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rps6ka4Q9Z2B9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rps6ka4Q9Z2B9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rps6ka4Q9Z2B9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Rps6ka4Q9Z2B9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rps6ka4Q9Z2B9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rps6ka4Q9Z2B9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rps6ka4Q9Z2B9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rps6ka4Q9Z2B9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rps6ka4Q9Z2B9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rps6ka4Q9Z2B9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rps6ka4Q9Z2B9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rps6ka4Q9Z2B9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rps6ka4Q9Z2B9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rps6ka4Q9Z2B9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rps6ka4Q9Z2B9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rps6ka4Q9Z2B9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rps6ka4Q9Z2B9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rps6ka4Q9Z2B9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rps6ka4Q9Z2B9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Rps6ka4Q9Z2B9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rps6ka4Q9Z2B9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rps6ka4Q9Z2B9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rps6ka4Q9Z2B9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rps6ka4Q9Z2B9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rps6ka4Q9Z2B9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rps6ka4Q9Z2B9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rps6ka4Q9Z2B9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rps6ka4Q9Z2B9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rps6ka4Q9Z2B9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rps6ka4Q9Z2B9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rps6ka4Q9Z2B9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rps6ka4Q9Z2B9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rps6ka4Q9Z2B9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rps6ka4Q9Z2B9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rps6ka4Q9Z2B9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rps6ka4Q9Z2B9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rps6ka4Q9Z2B9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rps6ka4Q9Z2B9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Rps6ka4Q9Z2B9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rps6ka4Q9Z2B9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rps6ka4Q9Z2B9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rps6ka4Q9Z2B9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rps6ka4Q9Z2B9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Rps6ka4Q9Z2B9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rps6ka4Q9Z2B9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rps6ka4Q9Z2B9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Rps6ka4Q9Z2B9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms