Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ilf3Q9Z1X4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ilf3Q9Z1X4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ilf3Q9Z1X4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ilf3Q9Z1X4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ilf3Q9Z1X4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ilf3Q9Z1X4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ilf3Q9Z1X4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ilf3Q9Z1X4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ilf3Q9Z1X4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ilf3Q9Z1X4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ilf3Q9Z1X4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ilf3Q9Z1X4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ilf3Q9Z1X4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ilf3Q9Z1X4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ilf3Q9Z1X4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ilf3Q9Z1X4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ilf3Q9Z1X4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ilf3Q9Z1X4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ilf3Q9Z1X4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ilf3Q9Z1X4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ilf3Q9Z1X4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ilf3Q9Z1X4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ilf3Q9Z1X4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ilf3Q9Z1X4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ilf3Q9Z1X4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ilf3Q9Z1X4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ilf3Q9Z1X4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ilf3Q9Z1X4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ilf3Q9Z1X4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ilf3Q9Z1X4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ilf3Q9Z1X4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ilf3Q9Z1X4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ilf3Q9Z1X4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ilf3Q9Z1X4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ilf3Q9Z1X4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ilf3Q9Z1X4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ilf3Q9Z1X4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ilf3Q9Z1X4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ilf3Q9Z1X4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ilf3Q9Z1X4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ilf3Q9Z1X4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ilf3Q9Z1X4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ilf3Q9Z1X4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ilf3Q9Z1X4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ilf3Q9Z1X4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ilf3Q9Z1X4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ilf3Q9Z1X4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ilf3Q9Z1X4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ilf3Q9Z1X4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ilf3Q9Z1X4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ilf3Q9Z1X4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ilf3Q9Z1X4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ilf3Q9Z1X4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ilf3Q9Z1X4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ilf3Q9Z1X4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ilf3Q9Z1X4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ilf3Q9Z1X4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ilf3Q9Z1X4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ilf3Q9Z1X4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ilf3Q9Z1X4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ilf3Q9Z1X4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ilf3Q9Z1X4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ilf3Q9Z1X4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ilf3Q9Z1X4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ilf3Q9Z1X4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ilf3Q9Z1X4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ilf3Q9Z1X4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ilf3Q9Z1X4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ilf3Q9Z1X4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ilf3Q9Z1X4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ilf3Q9Z1X4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ilf3Q9Z1X4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ilf3Q9Z1X4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ilf3Q9Z1X4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ilf3Q9Z1X4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ilf3Q9Z1X4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ilf3Q9Z1X4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ilf3Q9Z1X4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ilf3Q9Z1X4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ilf3Q9Z1X4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ilf3Q9Z1X4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ilf3Q9Z1X4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ilf3Q9Z1X4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ilf3Q9Z1X4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ilf3Q9Z1X4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ilf3Q9Z1X4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ilf3Q9Z1X4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ilf3Q9Z1X4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ilf3Q9Z1X4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Ilf3Q9Z1X4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ilf3Q9Z1X4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ilf3Q9Z1X4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ilf3Q9Z1X4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ilf3Q9Z1X4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ilf3Q9Z1X4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ilf3Q9Z1X4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ilf3Q9Z1X4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ilf3Q9Z1X4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ilf3Q9Z1X4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms