Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VarsQ9Z1Q9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VarsQ9Z1Q9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VarsQ9Z1Q9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VarsQ9Z1Q9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VarsQ9Z1Q9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VarsQ9Z1Q9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VarsQ9Z1Q9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VarsQ9Z1Q9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VarsQ9Z1Q9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VarsQ9Z1Q9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VarsQ9Z1Q9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VarsQ9Z1Q9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VarsQ9Z1Q9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VarsQ9Z1Q9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VarsQ9Z1Q9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VarsQ9Z1Q9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VarsQ9Z1Q9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VarsQ9Z1Q9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VarsQ9Z1Q9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VarsQ9Z1Q9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VarsQ9Z1Q9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VarsQ9Z1Q9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VarsQ9Z1Q9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VarsQ9Z1Q9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VarsQ9Z1Q9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VarsQ9Z1Q9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VarsQ9Z1Q9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VarsQ9Z1Q9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VarsQ9Z1Q9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VarsQ9Z1Q9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VarsQ9Z1Q9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VarsQ9Z1Q9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VarsQ9Z1Q9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VarsQ9Z1Q9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VarsQ9Z1Q9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VarsQ9Z1Q9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VarsQ9Z1Q9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VarsQ9Z1Q9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VarsQ9Z1Q9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VarsQ9Z1Q9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
VarsQ9Z1Q9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
VarsQ9Z1Q9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VarsQ9Z1Q9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VarsQ9Z1Q9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VarsQ9Z1Q9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VarsQ9Z1Q9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VarsQ9Z1Q9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VarsQ9Z1Q9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VarsQ9Z1Q9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VarsQ9Z1Q9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VarsQ9Z1Q9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VarsQ9Z1Q9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VarsQ9Z1Q9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VarsQ9Z1Q9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VarsQ9Z1Q9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VarsQ9Z1Q9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VarsQ9Z1Q9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VarsQ9Z1Q9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
VarsQ9Z1Q9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
VarsQ9Z1Q9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VarsQ9Z1Q9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VarsQ9Z1Q9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VarsQ9Z1Q9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VarsQ9Z1Q9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VarsQ9Z1Q9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VarsQ9Z1Q9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VarsQ9Z1Q9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VarsQ9Z1Q9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VarsQ9Z1Q9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VarsQ9Z1Q9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VarsQ9Z1Q9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VarsQ9Z1Q9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VarsQ9Z1Q9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VarsQ9Z1Q9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VarsQ9Z1Q9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VarsQ9Z1Q9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VarsQ9Z1Q9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VarsQ9Z1Q9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VarsQ9Z1Q9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VarsQ9Z1Q9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VarsQ9Z1Q9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VarsQ9Z1Q9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VarsQ9Z1Q9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VarsQ9Z1Q9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VarsQ9Z1Q9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VarsQ9Z1Q9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VarsQ9Z1Q9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VarsQ9Z1Q9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
VarsQ9Z1Q9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VarsQ9Z1Q9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VarsQ9Z1Q9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VarsQ9Z1Q9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VarsQ9Z1Q9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VarsQ9Z1Q9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VarsQ9Z1Q9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VarsQ9Z1Q9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VarsQ9Z1Q9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VarsQ9Z1Q9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VarsQ9Z1Q9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms