Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y9

Nr1h3, Oxysterols receptor LXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1h3Q9Z0Y9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nr1h3Q9Z0Y9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nr1h3Q9Z0Y9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nr1h3Q9Z0Y9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Nr1h3Q9Z0Y9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nr1h3Q9Z0Y9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Nr1h3Q9Z0Y9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nr1h3Q9Z0Y9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nr1h3Q9Z0Y9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nr1h3Q9Z0Y9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Nr1h3Q9Z0Y9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nr1h3Q9Z0Y9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Nr1h3Q9Z0Y9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nr1h3Q9Z0Y9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nr1h3Q9Z0Y9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nr1h3Q9Z0Y9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Nr1h3Q9Z0Y9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Nr1h3Q9Z0Y9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nr1h3Q9Z0Y9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Nr1h3Q9Z0Y9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nr1h3Q9Z0Y9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nr1h3Q9Z0Y9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nr1h3Q9Z0Y9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nr1h3Q9Z0Y9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nr1h3Q9Z0Y9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nr1h3Q9Z0Y9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nr1h3Q9Z0Y9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nr1h3Q9Z0Y9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nr1h3Q9Z0Y9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nr1h3Q9Z0Y9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nr1h3Q9Z0Y9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Nr1h3Q9Z0Y9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nr1h3Q9Z0Y9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nr1h3Q9Z0Y9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nr1h3Q9Z0Y9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nr1h3Q9Z0Y9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nr1h3Q9Z0Y9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nr1h3Q9Z0Y9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nr1h3Q9Z0Y9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nr1h3Q9Z0Y9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nr1h3Q9Z0Y9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nr1h3Q9Z0Y9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nr1h3Q9Z0Y9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nr1h3Q9Z0Y9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nr1h3Q9Z0Y9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nr1h3Q9Z0Y9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nr1h3Q9Z0Y9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nr1h3Q9Z0Y9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nr1h3Q9Z0Y9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Nr1h3Q9Z0Y9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nr1h3Q9Z0Y9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nr1h3Q9Z0Y9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nr1h3Q9Z0Y9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nr1h3Q9Z0Y9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nr1h3Q9Z0Y9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nr1h3Q9Z0Y9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nr1h3Q9Z0Y9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nr1h3Q9Z0Y9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nr1h3Q9Z0Y9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nr1h3Q9Z0Y9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nr1h3Q9Z0Y9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Nr1h3Q9Z0Y9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nr1h3Q9Z0Y9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Nr1h3Q9Z0Y9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nr1h3Q9Z0Y9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nr1h3Q9Z0Y9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nr1h3Q9Z0Y9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nr1h3Q9Z0Y9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nr1h3Q9Z0Y9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nr1h3Q9Z0Y9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nr1h3Q9Z0Y9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nr1h3Q9Z0Y9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nr1h3Q9Z0Y9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nr1h3Q9Z0Y9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Nr1h3Q9Z0Y9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nr1h3Q9Z0Y9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nr1h3Q9Z0Y9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nr1h3Q9Z0Y9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nr1h3Q9Z0Y9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nr1h3Q9Z0Y9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nr1h3Q9Z0Y9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Nr1h3Q9Z0Y9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nr1h3Q9Z0Y9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Nr1h3Q9Z0Y9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nr1h3Q9Z0Y9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nr1h3Q9Z0Y9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nr1h3Q9Z0Y9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nr1h3Q9Z0Y9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nr1h3Q9Z0Y9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.8 ms