Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E6

Gbp2, Guanylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp2Q9Z0E6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gbp2Q9Z0E6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gbp2Q9Z0E6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Gbp2Q9Z0E6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gbp2Q9Z0E6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gbp2Q9Z0E6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gbp2Q9Z0E6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Gbp2Q9Z0E6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gbp2Q9Z0E6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gbp2Q9Z0E6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gbp2Q9Z0E6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gbp2Q9Z0E6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gbp2Q9Z0E6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Gbp2Q9Z0E6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gbp2Q9Z0E6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Gbp2Q9Z0E6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gbp2Q9Z0E6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gbp2Q9Z0E6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gbp2Q9Z0E6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gbp2Q9Z0E6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gbp2Q9Z0E6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gbp2Q9Z0E6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gbp2Q9Z0E6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gbp2Q9Z0E6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gbp2Q9Z0E6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gbp2Q9Z0E6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gbp2Q9Z0E6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gbp2Q9Z0E6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gbp2Q9Z0E6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Gbp2Q9Z0E6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gbp2Q9Z0E6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gbp2Q9Z0E6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gbp2Q9Z0E6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gbp2Q9Z0E6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gbp2Q9Z0E6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gbp2Q9Z0E6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gbp2Q9Z0E6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gbp2Q9Z0E6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gbp2Q9Z0E6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gbp2Q9Z0E6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gbp2Q9Z0E6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gbp2Q9Z0E6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gbp2Q9Z0E6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gbp2Q9Z0E6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gbp2Q9Z0E6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gbp2Q9Z0E6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gbp2Q9Z0E6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gbp2Q9Z0E6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gbp2Q9Z0E6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gbp2Q9Z0E6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Gbp2Q9Z0E6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gbp2Q9Z0E6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gbp2Q9Z0E6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gbp2Q9Z0E6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gbp2Q9Z0E6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gbp2Q9Z0E6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gbp2Q9Z0E6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gbp2Q9Z0E6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gbp2Q9Z0E6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gbp2Q9Z0E6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gbp2Q9Z0E6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gbp2Q9Z0E6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gbp2Q9Z0E6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gbp2Q9Z0E6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gbp2Q9Z0E6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gbp2Q9Z0E6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gbp2Q9Z0E6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gbp2Q9Z0E6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gbp2Q9Z0E6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gbp2Q9Z0E6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gbp2Q9Z0E6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gbp2Q9Z0E6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gbp2Q9Z0E6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gbp2Q9Z0E6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gbp2Q9Z0E6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gbp2Q9Z0E6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gbp2Q9Z0E6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gbp2Q9Z0E6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gbp2Q9Z0E6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gbp2Q9Z0E6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gbp2Q9Z0E6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gbp2Q9Z0E6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gbp2Q9Z0E6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gbp2Q9Z0E6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gbp2Q9Z0E6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gbp2Q9Z0E6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gbp2Q9Z0E6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gbp2Q9Z0E6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gbp2Q9Z0E6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gbp2Q9Z0E6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gbp2Q9Z0E6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gbp2Q9Z0E6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gbp2Q9Z0E6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gbp2Q9Z0E6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gbp2Q9Z0E6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gbp2Q9Z0E6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gbp2Q9Z0E6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gbp2Q9Z0E6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gbp2Q9Z0E6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gbp2Q9Z0E6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms