Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
AireQ9Z0E3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AireQ9Z0E3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AireQ9Z0E3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AireQ9Z0E3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AireQ9Z0E3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AireQ9Z0E3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AireQ9Z0E3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AireQ9Z0E3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AireQ9Z0E3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AireQ9Z0E3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AireQ9Z0E3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AireQ9Z0E3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AireQ9Z0E3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AireQ9Z0E3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AireQ9Z0E3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AireQ9Z0E3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AireQ9Z0E3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AireQ9Z0E3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AireQ9Z0E3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AireQ9Z0E3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AireQ9Z0E3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AireQ9Z0E3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AireQ9Z0E3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AireQ9Z0E3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AireQ9Z0E3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AireQ9Z0E3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AireQ9Z0E3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AireQ9Z0E3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AireQ9Z0E3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AireQ9Z0E3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AireQ9Z0E3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AireQ9Z0E3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AireQ9Z0E3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AireQ9Z0E3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AireQ9Z0E3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AireQ9Z0E3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AireQ9Z0E3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AireQ9Z0E3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AireQ9Z0E3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AireQ9Z0E3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AireQ9Z0E3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AireQ9Z0E3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AireQ9Z0E3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AireQ9Z0E3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AireQ9Z0E3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AireQ9Z0E3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AireQ9Z0E3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AireQ9Z0E3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AireQ9Z0E3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AireQ9Z0E3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AireQ9Z0E3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AireQ9Z0E3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AireQ9Z0E3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AireQ9Z0E3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AireQ9Z0E3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
AireQ9Z0E3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
AireQ9Z0E3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AireQ9Z0E3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AireQ9Z0E3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AireQ9Z0E3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AireQ9Z0E3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AireQ9Z0E3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms