Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6W3

CAPN7, Calpain-7, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN7Q9Y6W3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPN7Q9Y6W3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPN7Q9Y6W3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPN7Q9Y6W3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPN7Q9Y6W3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPN7Q9Y6W3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPN7Q9Y6W3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN7Q9Y6W3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN7Q9Y6W3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN7Q9Y6W3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN7Q9Y6W3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN7Q9Y6W3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN7Q9Y6W3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN7Q9Y6W3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN7Q9Y6W3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN7Q9Y6W3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN7Q9Y6W3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN7Q9Y6W3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPN7Q9Y6W3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPN7Q9Y6W3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPN7Q9Y6W3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPN7Q9Y6W3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPN7Q9Y6W3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
CAPN7Q9Y6W3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN7Q9Y6W3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN7Q9Y6W3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN7Q9Y6W3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN7Q9Y6W3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN7Q9Y6W3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN7Q9Y6W3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CAPN7Q9Y6W3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN7Q9Y6W3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN7Q9Y6W3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN7Q9Y6W3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN7Q9Y6W3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN7Q9Y6W3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN7Q9Y6W3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN7Q9Y6W3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN7Q9Y6W3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN7Q9Y6W3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN7Q9Y6W3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN7Q9Y6W3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN7Q9Y6W3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPN7Q9Y6W3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPN7Q9Y6W3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPN7Q9Y6W3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPN7Q9Y6W3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPN7Q9Y6W3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPN7Q9Y6W3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN7Q9Y6W3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN7Q9Y6W3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN7Q9Y6W3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN7Q9Y6W3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPN7Q9Y6W3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPN7Q9Y6W3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPN7Q9Y6W3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPN7Q9Y6W3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPN7Q9Y6W3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPN7Q9Y6W3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN7Q9Y6W3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN7Q9Y6W3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN7Q9Y6W3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN7Q9Y6W3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPN7Q9Y6W3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPN7Q9Y6W3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPN7Q9Y6W3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPN7Q9Y6W3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPN7Q9Y6W3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPN7Q9Y6W3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPN7Q9Y6W3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPN7Q9Y6W3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPN7Q9Y6W3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAPN7Q9Y6W3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAPN7Q9Y6W3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPN7Q9Y6W3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPN7Q9Y6W3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPN7Q9Y6W3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPN7Q9Y6W3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPN7Q9Y6W3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPN7Q9Y6W3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPN7Q9Y6W3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPN7Q9Y6W3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPN7Q9Y6W3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPN7Q9Y6W3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPN7Q9Y6W3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPN7Q9Y6W3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPN7Q9Y6W3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPN7Q9Y6W3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPN7Q9Y6W3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPN7Q9Y6W3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPN7Q9Y6W3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPN7Q9Y6W3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPN7Q9Y6W3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPN7Q9Y6W3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPN7Q9Y6W3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPN7Q9Y6W3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPN7Q9Y6W3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPN7Q9Y6W3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPN7Q9Y6W3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPN7Q9Y6W3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms