Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6S9

RPS6KL1, Ribosomal protein S6 kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KL1Q9Y6S9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPS6KL1Q9Y6S9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPS6KL1Q9Y6S9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPS6KL1Q9Y6S9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPS6KL1Q9Y6S9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPS6KL1Q9Y6S9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPS6KL1Q9Y6S9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPS6KL1Q9Y6S9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPS6KL1Q9Y6S9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPS6KL1Q9Y6S9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPS6KL1Q9Y6S9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPS6KL1Q9Y6S9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPS6KL1Q9Y6S9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPS6KL1Q9Y6S9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPS6KL1Q9Y6S9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPS6KL1Q9Y6S9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPS6KL1Q9Y6S9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPS6KL1Q9Y6S9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RPS6KL1Q9Y6S9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPS6KL1Q9Y6S9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPS6KL1Q9Y6S9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPS6KL1Q9Y6S9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RPS6KL1Q9Y6S9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPS6KL1Q9Y6S9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPS6KL1Q9Y6S9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RPS6KL1Q9Y6S9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPS6KL1Q9Y6S9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPS6KL1Q9Y6S9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPS6KL1Q9Y6S9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPS6KL1Q9Y6S9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPS6KL1Q9Y6S9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPS6KL1Q9Y6S9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPS6KL1Q9Y6S9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPS6KL1Q9Y6S9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPS6KL1Q9Y6S9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPS6KL1Q9Y6S9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPS6KL1Q9Y6S9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPS6KL1Q9Y6S9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPS6KL1Q9Y6S9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPS6KL1Q9Y6S9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPS6KL1Q9Y6S9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPS6KL1Q9Y6S9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPS6KL1Q9Y6S9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPS6KL1Q9Y6S9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPS6KL1Q9Y6S9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPS6KL1Q9Y6S9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPS6KL1Q9Y6S9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPS6KL1Q9Y6S9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPS6KL1Q9Y6S9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPS6KL1Q9Y6S9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPS6KL1Q9Y6S9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPS6KL1Q9Y6S9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPS6KL1Q9Y6S9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPS6KL1Q9Y6S9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RPS6KL1Q9Y6S9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPS6KL1Q9Y6S9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPS6KL1Q9Y6S9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPS6KL1Q9Y6S9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPS6KL1Q9Y6S9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPS6KL1Q9Y6S9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPS6KL1Q9Y6S9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPS6KL1Q9Y6S9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPS6KL1Q9Y6S9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPS6KL1Q9Y6S9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPS6KL1Q9Y6S9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPS6KL1Q9Y6S9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPS6KL1Q9Y6S9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPS6KL1Q9Y6S9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPS6KL1Q9Y6S9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPS6KL1Q9Y6S9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPS6KL1Q9Y6S9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPS6KL1Q9Y6S9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPS6KL1Q9Y6S9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPS6KL1Q9Y6S9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPS6KL1Q9Y6S9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPS6KL1Q9Y6S9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RPS6KL1Q9Y6S9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPS6KL1Q9Y6S9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPS6KL1Q9Y6S9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPS6KL1Q9Y6S9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPS6KL1Q9Y6S9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPS6KL1Q9Y6S9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPS6KL1Q9Y6S9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPS6KL1Q9Y6S9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPS6KL1Q9Y6S9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPS6KL1Q9Y6S9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPS6KL1Q9Y6S9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPS6KL1Q9Y6S9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPS6KL1Q9Y6S9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPS6KL1Q9Y6S9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPS6KL1Q9Y6S9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPS6KL1Q9Y6S9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPS6KL1Q9Y6S9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPS6KL1Q9Y6S9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPS6KL1Q9Y6S9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPS6KL1Q9Y6S9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPS6KL1Q9Y6S9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPS6KL1Q9Y6S9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPS6KL1Q9Y6S9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPS6KL1Q9Y6S9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms